Proper experimental design requires randomization/balancing of molecular ecology experiments
- Properly designed (randomized and/or balanced) experiments are standard in ecological research. Molecular methods are increasingly used in ecology, but studies generally do not report the detailed design of sample processing in the laboratory. This may strongly influence the interpretability of results if the laboratory procedures do not account for the confounding effects of unexpected laboratory events. We demonstrate this with a simple experiment where unexpected differences in laboratory processing of samples would have biased results if randomization in DNA extraction and PCR steps do not provide safeguards. We emphasize the need for proper experimental design and reporting of the laboratory phase of molecular ecology research to ensure the reliability and interpretability of results.
Volltext Dateien herunterladen
SHA-1: afa51930ad12a3701eb0a65d30c55b5668d7326e
Weitere Dienste
| Verfasserangaben: | Miklós BálintORCiD, Orsolya Márton, Marlene Schatz, Rolf-Alexander Düring, Hans-Peter GrossartORCiDGND |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:kobv:517-opus4-423878 |
| DOI: | https://doi.org/10.25932/publishup-42387 |
| ISSN: | 1866-8372 |
| Titel des übergeordneten Werks (Englisch): | Postprints der Universität Potsdam : Mathematisch-Naturwissenschaftliche Reihe |
| Schriftenreihe (Bandnummer): | Zweitveröffentlichungen der Universität Potsdam : Mathematisch-Naturwissenschaftliche Reihe (616) |
| Publikationstyp: | Postprint |
| Sprache: | Englisch |
| Datum der Erstveröffentlichung: | 18.02.2019 |
| Erscheinungsjahr: | 2018 |
| Veröffentlichende Institution: | Universität Potsdam |
| Datum der Freischaltung: | 18.02.2019 |
| Freies Schlagwort / Tag: | DNA extraction; PCR; batch effect; bias; environmental DNA; laboratory practice; lake community; metabarcoding; nondemonic intrusions; sediment |
| Ausgabe: | 616 |
| Seitenanzahl: | 8 |
| Quelle: | Ecology and Evolution 8 (2018), pp. 1786–1793 DOI 10.1002/ece3.3687 |
| Organisationseinheiten: | Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät |
| DDC-Klassifikation: | 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 50 Naturwissenschaften / 500 Naturwissenschaften und Mathematik |
| 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 57 Biowissenschaften; Biologie / 570 Biowissenschaften; Biologie | |
| Peer Review: | Referiert |
| Publikationsweg: | Open Access |
| Lizenz (Deutsch): |  CC-BY - Namensnennung 4.0 International |
| Externe Anmerkung: | Bibliographieeintrag der Originalveröffentlichung/Quelle |
