Diffusivity estimation for activator-inhibitor models
- A theory for diffusivity estimation for spatially extended activator-inhibitor dynamics modeling the evolution of intracellular signaling networks is developed in the mathematical framework of stochastic reaction-diffusion systems. In order to account for model uncertainties, we extend the results for parameter estimation for semilinear stochastic partial differential equations, as developed in Pasemann and Stannat (Electron J Stat 14(1):547-579, 2020), to the problem of joint estimation of diffusivity and parametrized reaction terms. Our theoretical findings are applied to the estimation of effective diffusivity of signaling components contributing to intracellular dynamics of the actin cytoskeleton in the model organism Dictyostelium discoideum.
Verfasserangaben: | Gregor PasemannORCiDGND, Sven FlemmingORCiD, Sergio AlonsoORCiD, Carsten BetaORCiDGND, Wilhelm StannatORCiDGND |
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DOI: | https://doi.org/10.1007/s00332-021-09714-4 |
ISSN: | 0938-8974 |
ISSN: | 1432-1467 |
Titel des übergeordneten Werks (Englisch): | Journal of nonlinear science |
Untertitel (Englisch): | theory and application to intracellular dynamics of the actin cytoskeleton |
Verlag: | Springer |
Verlagsort: | New York |
Publikationstyp: | Wissenschaftlicher Artikel |
Sprache: | Englisch |
Datum der Erstveröffentlichung: | 03.05.2021 |
Erscheinungsjahr: | 2021 |
Datum der Freischaltung: | 26.02.2024 |
Freies Schlagwort / Tag: | Actin cytoskeleton dynamics; Maximum likelihood estimation; Parametric drift estimation; Stochastic reaction– diffusion; systems |
Band: | 31 |
Ausgabe: | 3 |
Aufsatznummer: | 59 |
Seitenanzahl: | 34 |
Fördernde Institution: | Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)German Research Foundation (DFG) [SFB1294/1-318763901, FEDER-PGC2018-095456-B-I00] |
Organisationseinheiten: | Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät / Institut für Physik und Astronomie |
DDC-Klassifikation: | 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 51 Mathematik / 510 Mathematik |
5 Naturwissenschaften und Mathematik / 53 Physik / 530 Physik | |
Peer Review: | Referiert |
Publikationsweg: | Open Access / Hybrid Open-Access |
Lizenz (Deutsch): | CC-BY - Namensnennung 4.0 International |