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Genomic analysis of three Clostridioides difficile isolates from urban water sources

  • We investigated inflow of a wastewater treatment plant and sediment of an urban lake for the presence of Clostridioides difficile by cultivation and PCR. Among seven colonies we sequenced the complete genomes of three: two non-toxigenic isolates from wastewater and one toxigenic isolate from the urban lake. For all obtained isolates, a close genomic relationship with human-derived isolates was observed. (C) 2019 Elsevier Ltd. All rights reserved.

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Verfasserangaben:Daniela Numberger, Thomas Riedel, Gayle McEwenORCiD, Ulrich Nübel, Martinique Frentrup, Isabel Schober, Boyke Bunk, Cathrin Spröer, Jörg Overmann, Hans-Peter GrossartORCiDGND, Alex D. Greenwood
DOI:https://doi.org/10.1016/j.anaerobe.2019.01.002
ISSN:1075-9964
ISSN:1095-8274
Pubmed ID:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30633971
Titel des übergeordneten Werks (Englisch):Anaerobe
Verlag:Elsevier
Verlagsort:Oxford
Publikationstyp:Wissenschaftlicher Artikel
Sprache:Englisch
Datum der Erstveröffentlichung:08.01.2019
Erscheinungsjahr:2019
Datum der Freischaltung:08.03.2021
Freies Schlagwort / Tag:Clostridioides difficile; Genomes; Sediment; Wastewater
Band:56
Seitenanzahl:5
Erste Seite:22
Letzte Seite:26
Fördernde Institution:project grant (IRG 3 -Water) from the Leibniz Research Alliance - Leibniz Association, Germany [SAS-2015-FZB-LFV]; Federal State of Lower Saxony, Niedersachsisches Vorab [VWZN3215/ZN3266]
Organisationseinheiten:Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät / Institut für Biochemie und Biologie
DDC-Klassifikation:5 Naturwissenschaften und Mathematik / 57 Biowissenschaften; Biologie / 570 Biowissenschaften; Biologie
Peer Review:Referiert
Verstanden ✔
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