Konservierte Struktur bei genetischer Mosaizität : die Tailspike Proteine dreier Phagen der Familie Podviridae
Tailspike proteins of three Podoviridae : genetic mosaics with conserved hreedimensional structure
- Die Tailspike Proteine (TSP) der Bakteriophagen P22, Sf6 und HK620 dienen der Erkennung von Kohlenhydratstrukturen auf ihren gram-negativen Wirtsbakterien und zeigen, von den ersten 110 Aminosäuren des N-Terminus abgesehen, keine Sequenzübereinstimmung. Mit Röntgenkristallstrukturanalyse konnte gezeigt werden, dass HK620TSP und Sf6TSP ebenfalls zu einer parallelen, rechtsgängigen beta-Helix falten, wie dies schon für P22TSP bekannt war. Die Kohlenhydratbindestelle ist bei Sf6TSP im Vergleich zu P22TSP zwischen die Untereinheiten verschoben.
- The bacteriophages P22, Sf6 and HK620 need their tailspike proteins (TSP) for recognition of surface carbohydrates on their gram-negative host bacteria. Sequence identity is completely lacking in their C-terminal 500 to 600 amino acids. The three TSP have the same fold, an oligomeric parallel beta-helix, as shown by crystal structure analyses of HK620TSP and Sf6TSP. Compared with P22TSP, the carbohydrate binding site of Sf6TSP is located at the interface between two monomers and not on a single monomer.
Author details: | Stefanie BarbirzORCiDGND |
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URN: | urn:nbn:de:kobv:517-opus-6885 |
Supervisor(s): | Robert Seckler |
Publication type: | Doctoral Thesis |
Language: | German |
Publication year: | 2005 |
Publishing institution: | Universität Potsdam |
Granting institution: | Universität Potsdam |
Date of final exam: | 2006/01/16 |
Release date: | 2006/04/07 |
Tag: | Kohlenhydrat-Protein-Wechselwirkung; Tailspike; genetisches Mosaik; parallele beta-Helix carbohydrate binding site; genetic mosaicism; parallel beta-helix; tailspike |
GND Keyword: | Bakteriophagen; Skleroproteine; Helix <beta->; Lipopolysaccharide |
RVK - Regensburg classification: | WF 3300 |
RVK - Regensburg classification: | WD 5500 |
Organizational units: | Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät / Institut für Biochemie und Biologie |
DDC classification: | 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 57 Biowissenschaften; Biologie / 570 Biowissenschaften; Biologie |