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Optical properties of modified diamondoids have been studied theoretically using vibrationally resolved electronic absorption, emission and resonance Raman spectra. A time-dependent correlation function approach has been used for electronic two-state models, comprising a ground state (g) and a bright, excited state (e), the latter determined from linear-response, time-dependent density functional theory (TD-DFT). The harmonic and Condon approximations were adopted. In most cases origin shifts, frequency alteration and Duschinsky rotation in excited states were considered. For other cases where no excited state geometry optimization and normal mode analysis were possible or desired, a short-time approximation was used. The optical properties and spectra have been computed for (i) a set of recently synthesized sp2/sp3 hybrid species with C[double bond, length as m-dash]C double-bond connected saturated diamondoid subunits, (ii) functionalized (mostly by thiol or thione groups) diamondoids and (iii) urotropine and other C-substituted diamondoids. The ultimate goal is to tailor optical and electronic features of diamondoids by electronic blending, functionalization and substitution, based on a molecular-level understanding of the ongoing photophysics.
Double cyclization of short linear peptides obtained by solid phase peptide synthesis was used to prepare bridged bicyclic peptides (BBPs) corresponding to the topology of bridged bicyclic alkanes such as norbornane. Diastereomeric norbornapeptides were investigated by 1H-NMR, X-ray crystallography and CD spectroscopy and found to represent rigid globular scaffolds stabilized by intramolecular backbone hydrogen bonds with scaffold geometries determined by the chirality of amino acid residues and sharing structural features of β-turns and α-helices. Proteome profiling by capture compound mass spectrometry (CCMS) led to the discovery of the norbornapeptide 27c binding selectively to calmodulin as an example of a BBP protein binder. This and other BBPs showed high stability towards proteolytic degradation in serum.
Brownianmotion is ergodic in the Boltzmann–Khinchin sense that long time averages of physical observables such as the mean squared displacement provide the same information as the corresponding ensemble average, even at out-of-equilibrium conditions. This property is the fundamental prerequisite for single particle tracking and its analysis in simple liquids. We study analytically and by event-driven molecular dynamics simulations the dynamics of force-free cooling granular gases and reveal a violation of ergodicity in this Boltzmann-Khinchin sense as well as distinct ageing of the system. Such granular gases comprise materials such as dilute gases of stones, sand, various types of powders, or large molecules, and their mixtures are ubiquitous in Nature and technology, in particular in Space. We treat—depending on the physical-chemical properties of the inter-particle interaction upon their pair collisions—both a constant and a velocity-dependent
(viscoelastic) restitution coefficient e. Moreover we compare the granular gas dynamics with an effective single particle stochastic model based on an underdamped Langevin equation with time dependent diffusivity. We find that both models share the same behaviour of the ensemble mean squared displacement (MSD) and the velocity correlations in the limit of weak dissipation. Qualitatively, the reported non-ergodic behaviour is generic for granular gases with any realistic dependence of e on the impact velocity of particles.
cis-Diamminedichloroplatinum(II) (Cisplatin) is one of the most important and frequently used cytostatic drugs for the treatment of various solid tumors. Herein, a laser ablation-inductively coupled plasma-mass spectrometry (LA-ICP-MS) method incorporating a fast and simple sample preparation protocol was developed for the elemental mapping of Cisplatin in the model organism Caenorhabditis elegans (C. elegans). The method allows imaging of the spatially-resolved elemental distribution of platinum in the whole organism with respect to the anatomic structure in L4 stage worms at a lateral resolution of 5 μm. In addition, a dose- and time-dependent Cisplatin uptake was corroborated quantitatively by a total reflection X-ray fluorescence spectroscopy (TXRF) method, and the elemental mapping indicated that Cisplatin is located in the intestine and in the head of the worms. Better understanding of the distribution of Cisplatin in this well-established model organism will be instrumental in deciphering Cisplatin toxicity and pharmacokinetics. Since the cytostatic effect of Cisplatin is based on binding the DNA by forming intra- and interstrand crosslinks, the response of poly(ADP-ribose)metabolism enzyme 1 (pme-1) deletion mutants to Cisplatin was also examined. Loss of pme-1, which is the C. elegans ortholog of human poly(ADP-ribose) polymerase 1 (PARP-1) led to disturbed DNA damage response. With respect to survival and brood size, pme-1 deletion mutants were more sensitive to Cisplatin as compared to wildtype worms, while Cisplatin uptake was indistinguishable.
What are the fundamental laws for the adsorption of charged polymers onto oppositely charged surfaces, for convex, planar, and concave geometries? This question is at the heart of surface coating applications, various complex formation phenomena, as well as in the context of cellular and viral biophysics. It has been a long-standing challenge in theoretical polymer physics; for realistic systems the quantitative understanding is however often achievable only by computer simulations. In this study, we present the findings of such extensive Monte-Carlo in silico experiments for polymer–surface adsorption in confined domains. We study the inverted critical adsorption of finite-length polyelectrolytes in three fundamental geometries: planar slit, cylindrical pore, and spherical cavity. The scaling relations extracted from simulations for the critical surface charge density sc—defining the adsorption–desorption transition—are in excellent agreement with our analytical calculations based on the ground-state analysis of the Edwards equation. In particular, we confirm the magnitude and scaling of sc for the concave interfaces versus the Debye screening length 1/k and the extent of confinement a for these three interfaces for small ka values. For large ka the critical adsorption condition approaches the known planar limit. The transition between the two regimes takes place when the radius of surface curvature or half of the slit thickness a is of the order of 1/k. We also rationalize how sc(k) dependence gets modified for semi-flexible versus flexible chains under external confinement. We examine the implications of the chain length for critical adsorption—the effect often hard to tackle theoretically—putting an emphasis on polymers inside attractive spherical cavities. The applications of our findings to some biological systems are discussed, for instance the adsorption of nucleic acids onto the inner surfaces of cylindrical and spherical viral capsids.
Ziel dieser Arbeit war die Synthese und Charakterisierung von neuartigen fluoreszierenden Copolymeren zur Analytdetektion in wässrigen Systemen. Das Detektionssystem sollte ein einfaches Schalten der Fluoreszenz bei Analytbindung „Aus“ bzw. Verdrängung „An“ ermöglichen. Dafür wurde die Synthese eines funktionalisierten Monomers so geplant, dass sich Fluorophor und Analyt innerhalb derselben Monomereinheit in direkter Nachbarschaft zueinander befinden. So sollten bei Erkennung des Analyten durch eine mit einem Fluoreszenzlöscher funktionalisierte Erkennungsstruktur Fluorophor und Löscher in einen vorgegebenen Abstand zueinander gezwungen und die Fluoreszenz des Fluorophors effizient gelöscht werden. Bei anschließender Verdrängung der Erkennungseinheit durch einen stärker bindenden Analyten sollte die Fluoreszenz wieder „angeschaltet“ werden. Eine weitere Zielstellung für das Detektionssystem war eine hohe Löslichkeit und Fluoreszenzintensität in Wasser. Da die Anwendung solcher Sensoren besonders in der Medizin und Biologie, z.B. für Schnellerkennungstest von Pathogenen, von Interesse ist, ist die Kompatibilität mit wässrigen Medien essentiell. Die funktionalisierten Monomere wurden frei radikalisch mit N Vinyl-pyrrolidon bzw. N Vinyl¬caprolactam zu wasserlöslichen, fluoreszierenden Copolymeren umgesetzt. In den N-Vinyl¬pyrrolidon-Polymeren (PNVP) wurde RhodaminB, in den thermoresponsiven N Vinyl¬caprolactam-Polymeren (PNVCL) ein Naphthalsäureimid als Fluorophor verwendet. Während Rhodamine eine hohe Fluoreszenzintensität, gute Quantenausbeuten und hohen Extinktionskoeffizienten in Wasser zeigen, sind Naphthalsäure¬imide umgebungssensitive Chromophore, die bei Änderung ihrer Lösungsmittelumgebung, wie z.B. beim Kollaps eines thermoresponsiven Polymers in Wasser, ihre Fluoreszenzintensität und Quantenausbeute drastisch ändern können. Der Vorteil der hier verwendeten Strategie der Monomersynthese liegt darin, dass bei jeder spezifischen Analytdetektion durch eine Erkennungseinheit die Fluoreszenz effizient gelöscht bzw. bei Verdrängung durch einen stärker bindenden Analyten wieder „angeschaltet“ wird. Dieses Prinzip wird bereits vielfach in der Biologie in sogenannten „Molecular Beacons“ ausgenutzt, wobei ein Fluorophor und ein Löscher durch spezifische DNA Basenpaarung in einen vorgegebenen Abstand zueinander gezwungen werden und so ein „Schalten“ der Fluoreszenz ermöglichen. Aufgrund der vorgegebenen Struktur der DNA Basensequenzen ist es jedoch nicht direkt auf andere Erkennungsreaktionen übertragbar. Daher wurde ein Modellsystem entwickelt, welches die Möglichkeit bietet Analyt, Erkennungseinheit und Signalgeber variabel, je nach Anforderungen des Systems, auszutauschen. So soll es möglich sein, den Sensor a priori für jede Erkennungs¬reaktion zu verwenden. Als Modell Bindungs¬paare wurden ß Cyclodextrin/Adamantan und Con¬cana¬valinA/Mannose ausgewählt. Adamantan bzw. Mannose wurde als Analyt zusammen mit dem Fluorophor in das Polymer eingebunden. ß Cyclo¬dextrin (ß CD) bzw. ConcanavalinA (ConA) wurde als Erkennungsstruktur an einem Fluoreszenzlöscher immobilisiert. Polymer-basierte Fluoreszenzsensoren sind in der Fachliteratur gut dokumentiert. In der Regel sind Signalgeber und Analyt jedoch statistisch im Polymer verteilt, da sie sich entweder in unterschiedlichen Monomereinheiten befinden oder die Funktionalisierung durch eine polymeranaloge Umsetzung erfolgt. Der gewählte Ansatz Fluorophor und Analyt innerhalb derselben Monomereinheit einzubinden, soll bei jeder Erkennungsreaktion des Analyten zu einer Änderung der Signalintensität des Fluorophors führen. Eine hohe Signalintensität bei Analytdetektion ist wünschenswert, insbesondere für Erkennungsreaktionen, die mit möglichst geringem apparativem Aufwand, am besten mit dem bloßen Auge zu verfolgen sein sollen. Des Weiteren ist es möglich den Fluorophorgehalt im Polymer genau einzustellen und so Selbstlöschung zu vermeiden. Die synthetisierten Polymere haben einen Fluorophorgehalt von 0,01 mol% bis 0,5 mol%. Für die RhodaminB haltigen Polymere zeigte sich, dass ein Fluorophorgehalt unterhalb 0,1 mol% im Polymer die höchsten Ausbeuten, Molmassen und Quantenausbeuten liefert. Für die Naphthalsäureimid haltigen Polymere hingegen wurden auch für einen Fluorophorgehalt von bis zu 1 mol% hohe Ausbeuten und Molmassen erreicht. Die Naphthalsäureimid haltigen Polymere haben jedoch in wässriger Lösungsmittelumgebung nur geringe Quantenausbeuten. Als Fluoreszenzlöscher wurden Goldnanopartikel synthetisiert, die mit den entsprechenden Erkennungsstrukturen (ß-CD oder ConA) für den verwendeten Analyten funktionalisiert wurden. Goldnanopartikel als Löscher bieten den Vorteil, dass ihre Dispergierbarkeit in einem Lösemittel durch Funktionalisierung ihrer Hülle gezielt gesteuert werden kann. Durch die hohe Affinität von Goldnanopartikeln zu Thiolen und Aminen konnten sie mit Hilfe einfacher Syntheseschritte mit Thio ß CD Derivaten bzw. ConA funktionalisiert werden. In der hier vorgelegten Arbeit sollte ein Modellsystem für einen solches fluoreszenz-basiertes Detektionssystem in Wasser entwickelt werden. Nachfolgend werden die zu erfüllenden strukturellen Voraussetzungen für die Synthese eines solchen Sensors nochmals zusammengefasst:
1. Verwendung eines Fluorophors, der eine hohe Signalintensität zeigt.
2. Analyt bzw. Erkennungseinheit soll sich im Abstand von wenigen Nanometern zum Signalgeber befinden, um bei jeder Detektionsreaktion die Signalintensität des Signalgebers beeinflussen zu können.
3. Die Detektionseinheit benötigt eine funktionelle Gruppe zur Immobilisierung. Immobilisierung kann z.B. durch Einbindung in ein Polymer erfolgen.
4. Der Fluorophor soll bei Änderung seiner lokalen Umgebung, durch Binden eines Löschers oder Änderung seiner Lösemittelumgebung seine Fluoreszenzeigenschaften drastisch ändern.
5. Die Reaktion sollte schnell und mit möglichst geringem apparativem Aufwand, am besten mit bloßem Auge zu verfolgen sein.
Für das ß-CD/Adamantan Modellsystem wurde ein Fluoreszenz Aus/An Sensor entwickelt, der bei Binden ß CD funktionalisierter Goldnanopartikel an das polymergebundene Adamantan die Fluoreszenz des RhodaminB Fluorophors effizient löscht und bei Verdrängung der Goldnanopartikel wieder zurück gewinnt. Dies konnte auch mit bloßem Auge verfolgt werden.
Für die Naphthalsäureimid Monomere, die mit NVCL copolymerisiert wurden, wurde abhängig von der lokalen Umgebung des Fluorophors eine unterschiedliche Verstärkung der Fluoreszenzintensität bei Überschreiten des Trübungspunktes des Polymers gefunden. Dabei zeigte sich, dass die Einführung eines Abstandshalters zwischen Polymerrückgrat und Fluorophor zu einer großen Fluoreszenz¬verstärkung führt, während sich ohne Abstandshalter die Fluoreszenzintensität bei Über¬schreiten des Trübungspunktes kaum ändert.
Diese Arbeit befasst sich mit der ganzheitlichen Betrachtung der Fluideigenschaften eines unterpermischen Reservoirs am Geothermie Forschungsstandort Groß Schönebeck (GrSk) bei Reservoirbedingungen und im Betrieb der Geothermieanlage. Die Untersuchungen zur Fluidherkunft ergeben, dass es sich um ein konnates Wasser meteorischen Ursprungs ohne den Einfluss der darüberliegenden Zechsteinwässer handelt. Die Ionen und Isotopenverhältnisse im Formationswasser gelöster Komponenten in GrSk belegen einen gemeinsamen Genesepfad mit Wässern anderer Rotliegend-Reservoire des Nordostdeutschen Beckens (NEGB). Die Isotopenverhältnisse von ⁸⁷Sr/⁸⁶Sr ≈ 0,7158 und von δ³⁴SV CDT ≈ 4,1 ‰ des Sulfats weisen auf die Anreicherung des Fluids mit schweren Isotopen durch die Fluid Gestein-Wechselwirkung mit Vulkaniten und Rotliegend Sandsteinen des Unteren Perms hin.
Das im Formationswasser bei Reservoirbedingungen gelöste Gas (Gas/Wasser ≤ 2 bei STP) enthält Stickstoff (δ¹⁵NAir ≈ 0,6 ‰) und thermogenes Methan (δ¹³CV-PDB ≈ - 18 ‰) aus organischen Karbonablagerungen (Kerogen Typ - III Kohlen) hoher Reife. Die Isotopenverhältnisse der Edelgase belegen eine krustale Herkunft des Gasgemisches. Die berechnete Verweilzeit τ (⁴He) der Gase im Reservoir liegt zwischen 275 und 317 Ma und überschreitet damit bei gegebener Konzentration von Mutternukliden im Reservoirgestein das allgemein angenommene Zeitalter der Sedimentgruppe. Das lässt sich durch eine Zuwanderung von Gasen aus älteren Sedimentfolgen erklären.
Die Veränderungen der physikochemischen Fluidparameter während des Anlagenbetriebs sind hauptsächlich temperaturbedingt. Bei stabilen Produktionsbedingungen und einer Temperatur von ca. 100 °C stabilisieren sich auch die Fluideigenschaften. Bei In situ Bedingungen übertage beträgt die Dichte ρ = 1,1325 ± 0,0002 g ∙ mL⁻¹, das Redoxpotential Eh = -105,5 ± 1,3 mV und der pH = 6,61 ± 0,002. Die relative Zusammensetzung der Gasphase bei stabilen Produktionsbedingungen zeigt dagegen eine geringe Erhöhung des Stickstoffanteils sowie des Anteils der Kohlenwasserstoffe (Ethan, Propan, usw.) und Abnahme des relativen Methananteils im Laufe des Betriebs.
Die quantitative Untersuchung der sekundären mineralischen Ausfällungen im Fluid mittels sequentieller Extraktion zeigte, dass Schwermetalle als eine Hauptkomponente der Fluidfestphase größtenteils in Verbindung mit organischen Molekülen vorliegen. Experimente zum Einfluss organischer Verbindungen unterschiedlicher Substanzklassen auf eine Mobilisierung der Schwermetalle aus dem Reservoirgestein ergaben, dass die Verbindungen wie Fettsäuren und PAK (polyzyklische aromatische Kohlenwasserstoffe) die Freisetzung von Kupfer, Nickel, Chrom und Blei verhindern bzw. zu derer Immobilisierung beitragen. Im Gegensatz dazu wird die Mobilität von Zink in Anwesenheit von diesen Verbindungen erhöht. Niedermolekulare Monocarbonsäuren und stickstoffhaltige Heteroaromaten tragen, mit Ausnahme von Blei, zur Freisetzung bzw. Mobilisierung von Schwermetallen aus dem Reservoirgestein bei.
Die gewonnenen Erkenntnisse dieser Arbeit bestätigen das Risiko massiver Ausfällungen auf der kalten Seite der Geothermieanlage bei Inbetriebnahme des Kraftwerks, wenn keine an den Fluidchemismus angepassten Präventionsmethoden eingesetzt werden. Die Isotopenzusammensetzung der Fluidkomponenten sowie geringfügige Schwankungen der Gaszusammensetzung im kontinuierlichen Anlagenbetrieb lässt eine Kommunikation des unterpermischen Reservoirs mit dem darunter liegenden Oberkarbon vermuten, was eine nachträgliche Veränderung der Fluidzusammensetzung beim Dauerbetrieb der Anlage bedeuten kann.
Die Doktorarbeit behandelt die Synthese Kohlenstoffnitrid basierter Materialien in eutektischen Mischungen bivalenter Metallchloride. Der Fokus liegt dabei auf ZnCl2-, SnCl2- und CoCl2-haltigen eutektischen Mischungen, in denen die Kondensation gebräuchlicher organischer Precursoren durchgeführt wird. Im Rahmen dessen wird untersucht wie durch die Reaktionsführung in Salzschmelzen unterschiedlicher Lewis-Acidität, neben der Molekülstruktur andere charakteristische Eigenschaften, wie Morphologie, Kristallinität und spezifische Oberflächen, der Materialien kontrolliert werden können. Darüber hinaus werden die optischen Eigenschaften der Materialien erörtert und in diesem Zusammenhang die Eignung als Photokatalysatoren für den oxidativen Abbau organischer Farbstoffe und für die photokatalytische Wasserreduktion bzw. –oxidation untersucht. Zusätzlich wird gezeigt, wie im System LiCl/KCl in einem einstufigen Prozess edelmetallfreie Kohlenstoffnitrid Komposite zur photokatalytischen Wasserreduktion hergestellt werden können.
The main focus of the present thesis was to investigate the stabilization ability of poly(ionic liquid)s (PILs) in several examples as well as develop novel chemical structures and synthetic routes of PILs. The performed research can be specifically divided into three parts that include synthesis and application of hybrid material composed of PIL and cellulose nanofibers (CNFs), thiazolium-containing PILs, and main-chain imidazolium-type PILs.
In the first chapter, a vinylimidazolium-type IL was polymerized in water in the presence of CNFs resulting in the in situ electrostatic grafting of polymeric chains onto the surface of CNFs. The synthesized hybrid material merged advantages of its two components, that is, superior mechanical strength of CNFs and anion dependent solution properties of PILs. In contrast to unmodified CNFs, the hybrid could be stabilized and processed in organic solvents enabling its application as reinforcing agent for porous polyelectrolyte membranes.
In the second part, PILs and ionic polymers containing two types of thiazolium repeating units were synthesized. Such polymers displayed counterion dependent thermal stability and solubility in organic solvents of various dielectric constants. This new class of PILs was tested as stabilizers and phase transfer agents for carbon nanotubes in aqueous and organic media, and as binder materials to disperse electroactive powders and carbon additives in solid electrode in lithium-ion batteries. The incorporation of S and N atoms into the polymeric structures make such PILs also potential precursors for S, N - co-doped carbons.
In the last chapter, reactants originating from biomass were successfully harnessed to synthesize main-chain imidazolium-type PILs. An imidazolium-type diester IL obtained via a modified Debus-Radziszewski reaction underwent transesterification with diol in a polycondensation reaction. This yielded a polyester-type PIL which CO2 sorption properties were investigated. In the next step, the modified Debus-Radziszewski reaction was further applied to synthesize main-chain PILs according to a convenient, one-step protocol, using water as a green solvent and simple organic molecules as reagents. Depending on the structure of the employed diamine, the synthesized PILs after anion exchange showed superior thermal stability with unusually high carbonization yields.
Overall, the outcome of these studies will actively contribute to the current research on PILs by introducing novel PIL chemical structures, improved synthetic routes, and new examples of stabilized materials. The synthesis of main-chain imidazolium-type PILs by a modified Debus-Radziszewski reaction is of a special interest for the future work on porous ionic liquid networks as well as colloidal PIL nanoparticles.
In this work we present a CMOS high frequency direct immunosensor operating at 6 GHz (C-band) for label free determination of creatinine. The sensor is fabricated in standard 0.13 μm SiGe:C BiCMOS process. The report also demonstrates the ability to immobilize creatinine molecules on a Si3N4 passivation layer of the standard BiCMOS/CMOS process, therefore, evading any further need of cumbersome post processing of the fabricated sensor chip. The sensor is based on capacitive detection of the amount of non-creatinine bound antibodies binding to an immobilized creatinine layer on the passivated sensor. The chip bound antibody amount in turn corresponds indirectly to the creatinine concentration used in the incubation phase. The determination of creatinine in the concentration range of 0.88–880 μM is successfully demonstrated in this work. A sensitivity of 35 MHz/10 fold increase in creatinine concentration (during incubation) at the centre frequency of 6 GHz is gained by the immunosensor. The results are compared with a standard optical measurement technique and the dynamic range and sensitivity is of the order of the established optical indication technique. The C-band immunosensor chip comprising an area of 0.3 mm2 reduces the sensing area considerably, therefore, requiring a sample volume as low as 2 μl. The small analyte sample volume and label free approach also reduce the experimental costs in addition to the low fabrication costs offered by the batch fabrication technique of CMOS/BiCMOS process.