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Das Akademienvorhaben „Alexander von Humboldt auf Reisen – Wissenschaft aus der Bewegung“ (AvH-R) hat Anfang 2015 mit einer projektierten Laufzeit von 18 Jahren seine Arbeit an der Berlin-Brandenburgischen Akademie der Wissenschaften aufgenommen. Die Hauptaufgabe von AvH-R besteht in der vollständigen Herausgabe der Humboldt‘schen Manuskripte zum Themenkomplex Reisen an der Schnittstelle von Kultur- und Naturwissenschaften. Die Schriftenreihe des Akademienvorhabens AvH-R läuft unter dem Titel Edition Humboldt und ist hybrid angelegt. Die Printedition der Tagebücher – Edition Humboldt – ist als Lesefassung konzipiert. Die Edition Humboldt digital zielt auf eine möglichst umfassende textorientierte Transkription und Kommentierung der Handschriften sowie auf eine intelligente Nutzung normdateibasierter Webdienste und Informationsangebote. Die ersten Ergebnisse wurden im Herbst 2016 der Öffentlichkeit unter avhr.bbaw.de präsentiert und werden hier zusammengefasst vorgestellt.
Alexander von Humboldt hat sich in jungen Jahren mit galvanischen Experimenten beschäftigt und die Resultate in einem umfassenden, zweibändigen Werk publiziert. Dabei zeigte er nicht nur, dass er als Experimentator und Teil der wissenschaftlichen Gemeinschaft fähig war, sich mit einem so neuen und komplexen Phänomen zu beschäftigen. Es lässt sich auch erkennen, dass er bereits in dieser frühen Schrift versuchte, das umfangreiche Wissen dem Leser zugänglich zu machen.
Der Artikel betrachtet Humboldts Galvanismusschrift Versuche über die gereizte Muskel- und Nervenfaser (1797–1798) und untersucht einige Elemente wie Anhänge und Schreibstil, die Humboldt nutzte, um die umfangreichen Informationen zu ordnen und dem Leser so neben den Big Data seiner Erkenntnisse auch passende Suchfunktionen zur Verfügung zu stellen, die eine gezielte Nutzung überhaupt ermöglichen.
Die Korrespondenz zwischen Alexander von Humboldt und Karl Kreil war umfangreich und betraf den Erdmagnetismus. Aber heute ist nur noch ein einziger Brief im Original bekannt. Dieser Brief, den Kreil am 3. September 1836 Alexander von Humboldt zukommen ließ, stimmt inhaltlich und teilweise wortwörtlich mit dem Brief überein, den Kreil nur einen Tag später, am 4. September 1836, an Carl Friedrich Gauß schickte. Vier Briefe von Kreil an Humboldt wurden in den „Annalen der Physik und Chemie“ publiziert, eine nicht allzu große Anzahl weiterer Briefe an Humboldt wurde in der biographischen Literatur über Kreil und in Briefen Kreils an Koller und Gauß erwähnt. Aber nicht nur die lückenhafte und bruchstückhaft bekannte Korrespondenz zwischen Humboldt und Kreil, die bis 1851 reicht, gibt Aufschluss über die Beziehungen, sondern von besonderer Bedeutung ist des Weiteren der Bestand an Kreiliana in der Bibliothek Humboldts. Es handelt sich um neun Werke Kreils, das letzte aus dem Jahr 1856. Nachweisbare Kontakte zwischen Kreil und Humboldt fanden also mit Sicherheit mindestens bis zu diesem Jahr statt!
El Ensayo sobre la geografía de las plantas de Alexander von Humboldt ha trascendido como una de sus principales propuestas científicas, fundamento de lo que se conoce hoy como “biogeografía”. El origen de este concepto es difuso hasta el momento de la publicación simultánea de su obra en París y en Tübingen, en 1807. El presente artículo propone contrastar la primera versión manuscrita de este ensayo, elaborada en 1803 en Guayaquil y luego leída en 1805 en el Institut National de Paris, con la obra contemporánea del neogranadino Francisco José de Caldas, con quien convivió en Quito en el primer semestre de 1802.
La référence à Colomb est un lieu commun de la biographie humboldtienne. Humboldt lui-même le souligne particulièrement dans son Examen critique, en y ajoutant une dimension autobiographique. La contribution analyse, dans une perspective philologique, le matériel et les formes de mise en scène avec lesquelles une vie est représentée au travers d'une autre.
Ein unveröffentlichter Brief Alexander von Humboldts an den Buchhändler Jean-Georges Treuttel
(2016)
In der Lilly Library der Indiana University befindet sich ein kurzer unveröffentlichter Brief Alexander von Humboldts an den Buchhändler und Autor Jean-Georges Treuttel. Dieser Artikel unternimmt den Versuch, den historisch-bibliographischen Kontext des Briefes herzustellen und ihn in Humboldts wissenschaftliches Schaffen einzuordnen.
Background: Endogenous murine leukemia retroviruses (MLVs) are high copy number proviral elements difficult to comprehensively characterize using standard low throughput sequencing approaches. However, high throughput approaches generate data that is challenging to process, interpret and present.
Results: Next generation sequencing (NGS) data was generated for MLVs from two wild caught Mus musculus domesticus (from mainland France and Corsica) and for inbred laboratory mouse strains C3H, LP/J and SJL. Sequence reads were grouped using a novel sequence clustering approach as applied to retroviral sequences. A Markov cluster algorithm was employed, and the sequence reads were queried for matches to specific xenotropic (Xmv), polytropic (Pmv) and modified polytropic (Mpmv) viral reference sequences.
Conclusions: Various MLV subtypes were more widespread than expected among the mice, which may be due to the higher coverage of NGS, or to the presence of similar sequence across many different proviral loci. The results did not correlate with variation in the major MLV receptor Xpr1, which can restrict exogenous MLVs, suggesting that endogenous MLV distribution may reflect gene flow more than past resistance to infection.
We extend the scope of European palaeogenomics by sequencing the genomes of Late Upper Palaeolithic (13,300 years old, 1.4-fold coverage) and Mesolithic (9,700 years old, 15.4-fold) males from western Georgia in the Caucasus and a Late Upper Palaeolithic (13,700 years old, 9.5-fold) male from Switzerland. While we detect Late Palaeolithic-Mesolithic genomic continuity in both regions, we find that Caucasus hunter-gatherers (CHG) belong to a distinct ancient clade that split from western hunter-gatherers similar to 45 kya, shortly after the expansion of anatomically modern humans into Europe and from the ancestors of Neolithic farmers similar to 25 kya, around the Last Glacial Maximum. CHG genomes significantly contributed to the Yamnaya steppe herders who migrated into Europe similar to 3,000 BC, supporting a formative Caucasus influence on this important Early Bronze age culture. CHG left their imprint on modern populations from the Caucasus and also central and south Asia possibly marking the arrival of Indo-Aryan languages.
Background: Development of eukaryotic organisms is controlled by transcription factors that trigger specific and global changes in gene expression programs. In plants, MADS-domain transcription factors act as master regulators of developmental switches and organ specification. However, the mechanisms by which these factors dynamically regulate the expression of their target genes at different developmental stages are still poorly understood.
Results: We characterized the relationship of chromatin accessibility, gene expression, and DNA binding of two MADS-domain proteins at different stages of Arabidopsis flower development. Dynamic changes in APETALA1 and SEPALLATA3 DNA binding correlated with changes in gene expression, and many of the target genes could be associated with the developmental stage in which they are transcriptionally controlled. We also observe dynamic changes in chromatin accessibility during flower development. Remarkably, DNA binding of APETALA1 and SEPALLATA3 is largely independent of the accessibility status of their binding regions and it can precede increases in DNA accessibility. These results suggest that APETALA1 and SEPALLATA3 may modulate chromatin accessibility, thereby facilitating access of other transcriptional regulators to their target genes.
Conclusions: Our findings indicate that different homeotic factors regulate partly overlapping, yet also distinctive sets of target genes in a partly stage-specific fashion. By combining the information from DNA-binding and gene expression data, we are able to propose models of stage-specific regulatory interactions, thereby addressing dynamics of regulatory networks throughout flower development. Furthermore, MADS-domain TFs may regulate gene expression by alternative strategies, one of which is modulation of chromatin accessibility.