Refine
Year of publication
Document Type
- Article (10)
- Monograph/Edited Volume (8)
- Review (3)
- Postprint (2)
- Part of Periodical (1)
- Preprint (1)
Is part of the Bibliography
- yes (25)
Keywords
- Chytridiomycota (3)
- Antarctica (2)
- Carlini Station (2)
- Illumina amplicon sequencing (2)
- aquatic fungi (2)
- phytoplankton (2)
- phytoplankton host (2)
- salinity gradient (2)
- Atlantic-ocean (1)
- Baltic Sea (1)
In humans, the L-cysteine desulfurase NFS1 plays a crucial role in the mitochondrial iron-sulfur cluster biosynthesis and in the thiomodification of mitochondrial and cytosolic tRNAs. We have previously demonstrated that purified NFS1 is able to transfer sulfur to the C-terminal domain of MOCS3, a cytosolic protein involved in molybdenum cofactor biosynthesis and tRNA thiolation. However, no direct evidence existed so far for the interaction of NFS1 and MOCS3 in the cytosol of human cells. Here, we present direct data to show the interaction of NFS1 and MOCS3 in the cytosol of human cells using Forster resonance energy transfer and a split-EGFP system. The colocalization of NFS1 and MOCS3 in the cytosol was confirmed by immunodetection of fractionated cells and localization studies using confocal fluorescence microscopy. Purified NFS1 was used to reconstitute the lacking molybdoenzyme activity of the Neurospora crassa nit-1 mutant, giving additional evidence that NFS1 is the sulfur donor for Moco biosynthesis in eukaryotes in general.
The homodinuclear ruthenium(II) complex [{Ru(l-N4Me2)}(2)(-tape)](PF6)(4) {[1](PF6)(4)} (l-N4Me2=N,N-dimethyl-2,11-diaza[3.3](2,6)-pyridinophane, tape=1,6,7,12-tetraazaperylene) can store one or two electrons in the energetically low-lying * orbital of the bridging ligand tape. The corresponding singly and doubly reduced complexes [{Ru(l-N4Me2)}(2)(-tape(.-))](PF6)(3) {[2](PF6)(3)} and [{Ru(l-N4Me2)}(2)(-tape(2-))](PF6)(2) {[3](PF6)(2)}, respectively, were electrochemically generated, successfully isolated and fully characterized by single-crystal X-ray crystallography, spectroscopic methods and magnetic susceptibility measurements. The singly reduced complex [2](PF6)(3) contains the -radical tape(.-) and the doubly reduced [3](PF6)(2) the diamagnetic dianion tape(2-) as bridging ligand, respectively. Nucleophilic aromatic substitution at the bridging tape in [1](4+) by two sulfite units gave the complex [{Ru(l-N4Me2)}(2){-tape-(SO3)(2)}](2+) ([4](2+)). Complex dication [4](2+) was exploited as a redox mediator between an anaerobic homogenous reaction solution of an enzyme system (sulfite/sulfite oxidase) and the electrode via participation of the low-energy *-orbital of the disulfonato-substituted bridging ligand tape-(SO3)(2)(2-) (E-red1=-0.1V versus Ag/AgCl/1m KCl in water).
This review presents recommended nomenclature for the biosynthesis of ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs), a rapidly growing class of natural products. The current knowledge regarding the biosynthesis of the >20 distinct compound classes is also reviewed, and commonalities are discussed.
Lange gab es auf der Erde Dinge, die konnte nur der Mensch. Doch diese Zeit könnte zu Ende gehen. Mithilfe des universalen Werkzeugs, das uns einzigartig macht – unserer Intelligenz –, haben wir dafür gesorgt, dass wir es nicht länger sind. Zumindest wenn es darum geht, kognitive Aufgaben zu lösen. Künstliche Intelligenz kann inzwischen Schach spielen, Sprache verstehen, Auto fahren. Vieles sogar besser als wir. Wie kam es dazu?
Der Philosoph Aristoteles schuf mit seinen Syllogismen die ersten „Gesetze des Denkens“, die Mathematiker Blaise Pascal und Wilhelm Leibniz bauten einige der frühesten Rechenmaschinen, der Mathematiker George Boole führte als erster eine formale Sprache zur Darstellung der Logik ein, der Naturwissenschaftler Alan Turing schuf mit seiner Dechiffriermaschine „Colossus“ den ersten programmierbaren Computer. Philosophen, Mathematiker, Psychologen, Linguisten – seit Jahrhunderten entwickeln Wissenschaftlerin- nen und Wissenschaftler Formeln, Maschinen und Theorien, die es möglich machen sollen, unsere wertvollste Fähigkeit zu reproduzieren und womöglich sogar zu verbessern. Aber was ist das eigentlich: „Künstliche Intelligenz“?
Schon die Bezeichnung fordert zum Vergleich auf. Ist Künstliche Intelligenz wie menschliche Intelligenz? Alan Turing formulierte 1950 einen Test, der eine befriedigende operationale Definition von Intelligenz liefern sollte: Intelligent ist eine Maschine demnach, wenn sie ein dem Menschen gleichwertiges Denkvermögen besitzt. Sie muss also bei beliebigen kognitiven Aufgaben dasselbe Niveau erreichen. Beweisen muss sie dies, indem sie einen menschlichen Fragenden glauben lässt, sie sei ein Mensch. Keine leichte Sache: Immerhin muss sie dafür natürliche Sprache verarbeiten, Wissen speichern, aus diesem Schlüsse ziehen und Neues lernen können. Tatsächlich entstanden in den vergangenen zehn Jahren etliche KI-Systeme, die in Chat- Gesprächen, mit automatisch erzeugten Texten oder Bildern den Test auf die eine oder andere Weise bestanden. Im Fokus stehen nun meist andere Fragen: Braucht KI ihre Schöpfer überhaupt noch? Wird sie den Menschen nicht nur überflügeln, sondern eines Tages sogar ersetzen – sei es in der Welt der Arbeit oder sogar darüber hinaus? Löst KI im Zeitalter der allumfassenden digitalen Vernetzung unsere Probleme – oder wird sie Teil davon?
Über Künstliche Intelligenz, ihr Wesen, ihre Beschränkungen, ihr Potenzial und ihr Verhältnis zum Menschen wird nicht erst diskutiert seitdem es sie gibt. Vor allem Literatur und Kino haben Szenarien mit verschiedenstem Ausgang kreiert. Aber wie sehen das Wissenschaftler, die mit oder zu Künstlicher Intelligenz forschen? Für die aktuelle Ausgabe des Forschungsmagazins kamen ein Kognitionswissenschaftler, eine Bildungsforscherin und ein Informatiker darüber ins Gespräch. Daneben haben wir uns in der Hochschule nach Projekten umgesehen, deren fachliche Heimat die zahlreichen Möglichkeiten offenbart, die KI für viele Disziplinen erahnen lässt. So geht die Reise in die Geowissenschaften und die Informatik ebenso wie die Wirtschafts-, Gesundheits- und Literaturwissenschaften.
Daneben haben wir die Breite der Forschung an der Universität nicht aus den Augen verloren: Ein Jurist führt ein in die gar nicht so weltferne Sphäre des Weltraumrechts, während Astrophysiker daran arbeiten, dass modernste Teleskope zum richtigen Zeitpunkt genau in die Regionen des Weltraums schauen, wo gerade etwas „los ist“. Eine Chemikerin erklärt, warum die Batterie der Zukunft aus dem Drucker kommt, und Molekularbiologen berichten, wie sie stressresistente Pflanzen züchten wollen. Mit menschlichem Stress in der Arbeitswelt beschäftigt sich nicht nur ein Forschungs-, sondern auch ein Gründerprojekt. Darüber ist in diesem Heft genauso zu lesen wie über aktuelle Studien zum Restless Legs Syndrom bei Kindern oder aber der Situation von Muslimen in Brandenburg. Nicht zuletzt machen wir Sie mit jenen Schafen bekannt, die derzeit im Park Sanssouci weiden – im Auftrag der Wissenschaft. Gar nicht so dumm! Viel Vergnügen!
Die Redaktion
Modulating the Molybdenum Coordination Sphere of Escherichia coli Trimethylamie N-Oxide Reductase
(2018)
The well-studied enterobacterium Escherichia coli present in the human gut can reduce trimethylamine N-oxide (TMAO) to trimethylamine during anaerobic respiration. The TMAO reductase TorA is a monomeric, bis-molybdopterin guanine dinucleotide (bis-MGD) cofactor-containing enzyme that belongs to the dimethyl sulfoxide reductase family of molybdoenzymes. We report on a system for the in vitro reconstitution of TorA with molybdenum cofactors (Moco) from different sources. Higher TMAO reductase activities for TorA were obtained when using Moco sources containing a sulfido ligand at the molybdenum atom. For the first time, we were able to isolate functional bis-MGD from Rhodobacter capsulatus formate dehydrogenase (FDH), which remained intact in its isolated state and after insertion into apo-TorA yielded a highly active enzyme. Combined characterizations of the reconstituted TorA enzymes by electron paramagnetic resonance spectroscopy and direct electrochemistry emphasize that TorA activity can be modified by changes in the Mo coordination sphere. The combination of these results together with studies of amino acid exchanges at the active site led us to propose a novel model for binding of the substrate to the molybdenum atom of TorA.
Contents: 1. Introduction 2. Migration and Assimilation – Theoretical Approaches 2.1 Meaning and Definition of the Terms Migration and Migrant 2.2 Milton M. Gordon – Sub Processes of Assimilation 2.3 Hartmut Esser - Acculturation, Integration, and Assimilation 2.4 The Concept of Integration and Assimilation 2.5 Straight–line Assimilation and its Implications 2.6 Segmented Assimilation and its Implications 3. Social Inequality and Welfare – Theoretical Approaches 3.1 Dimensions of Inequality 3.2 Welfare Regimes and Social Inequality 3.3 Migration, Assimilation and Inequality 4. Research Design 4.1 Research Question and General Proceeding 4.2 Sample and Data Base 4.3 Operationalisation and Indicators 5. Migration, Welfare and Inequality in Three European Countries 6. Empirical Results 6.1 Performance of Migrants Compared With Natives 6.2 Different Trajectories of Assimilation 6.3 Trajectories of Segmented Assimilation and their Determinants 6.4 Policies, Attitudes and Assimilation – An Aggregate Analysis 6.5 Summary – What Determines the Performance of Migrants? 7. Discussion of Empirical Results in Terms of Theoretical Approaches 7.1 The Situation of Migrants in Three European Countries 7.2 Assessment of the Trajectories of Assimilation 8. Conclusion – Future Prospects of Migration in Europe
Chytridiomycota, often referred to as chytrids, can be virulent parasites with the potential to inflict mass mortalities on hosts, causing e.g. changes in phytoplankton size distributions and succession, and the delay or suppression of bloom events. Molecular environmental surveys have revealed an unexpectedly large diversity of chytrids across a wide range of aquatic ecosystems worldwide. As a result, scientific interest towards fungal parasites of phytoplankton has been gaining momentum in the past few years. Yet, we still know little about the ecology of chytrids, their life cycles, phylogeny, host specificity and range. Information on the contribution of chytrids to trophic interactions, as well as co-evolutionary feedbacks of fungal parasitism on host populations is also limited. This paper synthesizes ideas stressing the multifaceted biological relevance of phytoplankton chytridiomycosis, resulting from discussions among an international team of chytrid researchers. It presents our view on the most pressing research needs for promoting the integration of chytrid fungi into aquatic ecology.
Fungi in aquatic ecosystems
(2019)
Fungi are phylogenetically and functionally diverse ubiquitous components of almost all ecosystems on Earth, including aquatic environments stretching from high montane lakes down to the deep ocean. Aquatic ecosystems, however, remain frequently overlooked as fungal habitats, although fungi potentially hold important roles for organic matter cycling and food web dynamics. Recent methodological improvements have facilitated a greater appreciation of the importance of fungi in many aquatic systems, yet a conceptual framework is still missing. In this Review, we conceptualize the spatiotemporal dimensions, diversity, functions and organismic interactions of fungi in structuring aquatic food webs. We focus on currently unexplored fungal diversity, highlighting poorly understood ecosystems, including emerging artificial aquatic habitats.