Bio-jETI
- Background: With Bio-jETI, we introduce a service platform for interdisciplinary work on biological application domains and illustrate its use in a concrete application concerning statistical data processing in R and xcms for an LC/MS analysis of FAAH gene knockout. Methods: Bio-jETI uses the jABC environment for service-oriented modeling and design as a graphical process modeling tool and the jETI service integration technology for remote tool execution. Conclusions: As a service definition and provisioning platform, Bio-jETI has the potential to become a core technology in interdisciplinary service orchestration and technology transfer. Domain experts, like biologists not trained in computer science, directly define complex service orchestrations as process models and use efficient and complex bioinformatics tools in a simple and intuitive way.
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| Verfasserangaben: | Tiziana MargariaORCiDGND, Christian Kubczak, Bernhard Steffen |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:kobv:517-opus4-428868 |
| DOI: | https://doi.org/10.25932/publishup-42886 |
| Titel des übergeordneten Werks (Deutsch): | Postprints der Universität Potsdam : Mathematisch-Naturwissenschaftliche Reihe |
| Untertitel (Englisch): | a service integration, design, and provisioning platform for orchestrated bioinformatics processes |
| Schriftenreihe (Bandnummer): | Zweitveröffentlichungen der Universität Potsdam : Mathematisch-Naturwissenschaftliche Reihe (822) |
| Publikationstyp: | Postprint |
| Sprache: | Englisch |
| Datum der Erstveröffentlichung: | 20.02.2020 |
| Erscheinungsjahr: | 2008 |
| Veröffentlichende Institution: | Universität Potsdam |
| Datum der Freischaltung: | 20.02.2020 |
| Freies Schlagwort / Tag: | composite service; electronic tool integration; fatty acid amide hydrolase; rest service; service orchestration |
| Ausgabe: | 822 |
| Seitenanzahl: | 19 |
| Quelle: | BMC Bioinformatics 9 (2008) 4 DOI: 10.1186/1471-2105-9-S4-S12 |
| Organisationseinheiten: | Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät |
| DDC-Klassifikation: | 0 Informatik, Informationswissenschaft, allgemeine Werke / 00 Informatik, Wissen, Systeme / 004 Datenverarbeitung; Informatik |
| 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 57 Biowissenschaften; Biologie / 570 Biowissenschaften; Biologie | |
| 6 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / 61 Medizin und Gesundheit / 610 Medizin und Gesundheit | |
| Peer Review: | Referiert |
| Publikationsweg: | Open Access |
| Lizenz (Englisch): |  Creative Commons - Namensnennung 2.0 Generic |
