@phdthesis{Boeuf2002,
  author    = {Boeuf, St{\´e}phane},
  title     = {Comparative study of gene expression during the differentiation of white and brown preadipocytes},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:517-0000542},
  school      = {Universit{\"a}t Potsdam},
  year      = {2002},
  abstract  = {Einleitung S{\"a}ugetiere haben zwei verschiedene Arten von Fettgewebe: das weiße Fettgewebe, welches vorwiegend zur Lipidspeicherung dient, und das braune Fettgewebe, welches sich durch seine F{\"a}higkeit zur zitterfreien Thermogenese auszeichnet. Weiße und braune Adipozyten sind beide mesodermalen Ursprungs. Die Mechanismen, die zur Entwicklung von Vorl{\"a}uferzellen in den weißen oder braunen Fettzellphenotyp f{\"u}hren, sind jedoch unbekannt. Durch verschiedene experimentelle Ans{\"a}tze konnte gezeigt werden, daß diese Adipocyten vermutlich durch die Differenzierung zweier Typen unterschiedlicher Vorl{\"a}uferzellen entstehen: weiße und braune Preadipozyten. Von dieser Hypothese ausgehend, war das Ziel dieser Studie, die Genexpression weißer und brauner Preadipozyten auf Unterschiede systematisch zu analysieren. Methoden Die zu vergleichenden Zellen wurden aus prim{\"a}ren Zellkulturen weißer und brauner Preadipozyten des dsungarischen Zwerghamsters gewonnen. „Representational Difference Analysis" wurde angewandt, um potentiell unterschiedlich exprimierte Gene zu isolieren. Die daraus resultierenden cDNA Fragmente von Kandidatengenen wurden mit Hilfe der Microarraytechnik untersucht. Die Expression dieser Gene wurde in braunen und weißen Fettzellen in verschiedenen Differenzierungsstadien und in braunem und weißem Fettgewebe verglichen. Ergebnisse 12 Gene, die in braunen und weißen Preadipozyten unterschiedlich exprimiert werden, konnten identifiziert werden. Drei Komplement Faktoren und eine Fetts{\"a}uren Desaturase werden in weißen Preadipozyten h{\"o}her exprimiert; drei Struktur Gene (Fibronectin, Metargidin und a Actinin 4), drei Gene verbunden mit transkriptioneller Regulation (Necdin, Vigilin und das „small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A") sowie zwei Gene unbekannter Funktion werden in braunen Preadipozyten h{\"o}her exprimiert. Mittels Clusteranalyse (oder Gruppenanalyse) wurden die gesamten Genexpressionsdaten charakterisiert. Dabei konnten die Gene in 4 typischen Expressionsmuster aufgeteilt werden: in weißen Preadipozyten h{\"o}her exprimierte Gene, in braunen Preadipozyten h{\"o}her exprimierte Gene, w{\"a}hrend der Differenzierung herunter regulierte Gene und w{\"a}hrend der Differenzierung hoch regulierte Gene. Schlußfolgerungen In dieser Studie konnte gezeigt werden, daß weiße und braune Preadipozyten aufgrund der Expression verschiedener Gene unterschieden werden k{\"o}nnen. Es wurden mehrere Kandidatengene zur Bestimmung weißer und brauner Preadipozyten identifiziert. Außerdem geht aus den Genexpressionsdaten hervor, daß funktionell unterschiedliche Gruppen von Genen eine wichtige Rolle bei der Differenzierung von weißen und braunen Preadipozyten spielen k{\"o}nnten, wie z.B. Gene des Komplementsystems und der extrazellul{\"a}ren Matrix.},
  subject      = {S{\"a}ugetiere ; Fettgewebe ; Zelldifferenzierung ; Genexpression},
  language  = {en}
}
@phdthesis{Kuester2009,
  author    = {K{\"u}ster, Katrin},
  title     = {Die funktionelle Bedeutung des Coxsackie- und Adenovirus Rezeptors (CAR) im kolorektalen Karzinom},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:517-opus-31617},
  school      = {Universit{\"a}t Potsdam},
  year      = {2009},
  abstract  = {Der Coxsackie- und Adenovirus Rezeptor (CAR) ist als Bestandteil von Tight Junctions (TJ) an interzellul{\"a}ren Adh{\"a}sionsprozessen beteiligt und scheint eine wichtige Rolle in der Karzinogenese zu spielen. Diese ist jedoch insbesondere bei Entstehung von Darmkrebs weitgehend unklar. Ziel der Arbeit war es daher, die funktionelle Bedeutung, m{\"o}gliche Interaktionspartner sowie die Expressionsregulation von CAR im kolorektalen Karzinom zu analysieren. In den Zelllinien CaCo2, Colo205, DLD1, HCT116, HT29, SW480 und T84 konnte die Expression von CAR (mRNA und Protein) nachgewiesen werden. Nach stabiler CAR-{\"U}berexpression durch Transfektion von CARcDNA in DLD1, HCT116 und SW480 wurde das Zellwachstum gehemmt und eine Abnahme von Migration und Invasion induziert. Eine stabile CAR-Inhibition nach Transfektion von CARsiRNA f{\"u}hrte in diesen Zelllinien zum Anstieg der Proliferation sowie zu verst{\"a}rkter Migrations- und Invasionsaktivit{\"a}t, die in DLD1 mit morphologischen {\"A}nderungen einhergingen. Eine Genexpressionsanalyse der Zelllinie DLD1 mit CAR-Inhibition identifizierte α-Catenin als das am st{\"a}rksten regulierte Gen. Obwohl keine direkte Interaktion beider Proteine detektiert werden konnte, f{\"u}hrte eine stabile Re-Expression von α-Catenin in DLD1 mit stabiler CAR-Inhibition zu einer deutlichen Reduktion von Proliferation, Migration und Invasion sowie zu einem R{\"u}ckgang der zellmorphologischen {\"A}nderungen. Um den Einfluss von Differenzierung auf die Regulation der CAR-Expression zu untersuchen, erfolgte eine Behandlung aller Zelllinien mit Natriumbutyrat. Dies f{\"u}hrte in f{\"u}nf der sieben Zelllinien zu einer Aktivierung des CAR-Promotors sowie zu einer gesteigerten Expression und Immunoreaktivit{\"a}t von CAR an der Zelloberfl{\"a}che. Die Zelllinie CaCo2 zeigte nach spontaner Differenzierung durch 21-t{\"a}giges Wachstum post Konfluenz ebenfalls eine verst{\"a}rkte CAR-mRNA-Expression sowie eine erh{\"o}hte CAR-Pr{\"a}senz an der Zelloberfl{\"a}che. Die gewonnenen Daten konnten die funktionelle Bedeutung von CAR f{\"u}r die Kolonkarzinogenese sowie den Einfluss von α-Catenin auf diese Funktion deutlich machen. Es wurde gezeigt, dass die Expressionsregulation sowie die subzellul{\"a}re Verteilung von CAR durch den zellul{\"a}ren Differenzierungsstatus beeinflusst werden kann.},
  language  = {de}
}
@misc{MerksSwinarskiMeyeretal.2018,
  author    = {Merks, Anne Margarete and Swinarski, Marie and Meyer, Alexander Matthias and M{\"u}ller, Nicola Victoria and {\"O}zcan, Ismail and Donat, Stefan and Burger, Alexa and Gilbert, Stephen and Mosimann, Christian and Abdelilah-Seyfried, Salim and Pan{\´a}kov{\´a}, Daniela},
  title     = {Planar cell polarity signalling coordinates heart tube remodelling through tissue-scale polarisation of actomyosin activity},
  series = {Postprints der Universit{\"a}t Potsdam : Mathematisch Naturwissenschaftliche Reihe},
  journal   = {Postprints der Universit{\"a}t Potsdam : Mathematisch Naturwissenschaftliche Reihe},
  number    = {849},
  issn      = {1866-8372},
  doi       = {10.25932/publishup-42702},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:517-opus4-427026},
  pages     = {17},
  year      = {2018},
  abstract  = {Development of a multiple-chambered heart from the linear heart tube is inherently linked to cardiac looping. Although many molecular factors regulating the process of cardiac chamber ballooning have been identified, the cellular mechanisms underlying the chamber formation remain unclear. Here, we demonstrate that cardiac chambers remodel by cell neighbour exchange of cardiomyocytes guided by the planar cell polarity (PCP) pathway triggered by two non-canonical Wnt ligands, Wnt5b and Wnt11. We find that PCP signalling coordinates the localisation of actomyosin activity, and thus the efficiency of cell neighbour exchange. On a tissue-scale, PCP signalling planar-polarises tissue tension by restricting the actomyosin contractility to the apical membranes of outflow tract cells. The tissue-scale polarisation of actomyosin contractility is required for cardiac looping that occurs concurrently with chamber ballooning. Taken together, our data reveal that instructive PCP signals couple cardiac chamber expansion with cardiac looping through the organ-scale polarisation of actomyosin-based tissue tension.},
  language  = {en}
}
@article{PengZhuDongetal.2015,
  author    = {Peng, Tao and Zhu, Ganghua and Dong, Yunpeng and Zeng, Junjie and Li, Wei and Guo, Weiwei and Chen, Yong and Duan, Maoli and Hocher, Berthold and Xie, Dinghua},
  title     = {BMP4: a possible key factor in differentiation of auditory neuron-like cells from bone-derived mesenchymal stromal cells},
  series = {Clinical laboratory : the peer reviewed journal for clinical laboratories and laboratories related to blood transfusion},
  volume    = {61},
  journal   = {Clinical laboratory : the peer reviewed journal for clinical laboratories and laboratories related to blood transfusion},
  number    = {9},
  publisher = {Clin Lab Publ., Verl. Klinisches Labor},
  address   = {Heidelberg},
  issn      = {1433-6510},
  doi       = {10.7754/Clin.Lab.2015.150217},
  pages     = {1171 -- 1178},
  year      = {2015},
  abstract  = {Background: Previous studies have shown that BMP4 may play an important part in the development of auditory neurons (ANs), which are degenerated in sensorineural hearing loss. However, whether BMP4 can promote sensory fate specification from mesenchymal stromal cells (MSCs) is unknown so far. Methods: MSCs isolated from Sprague-Dawley (SD) rats were confirmed by expression of MSC markers using flow cytometry and adipogenesis/osteogenesis using differentiation assays. MSCs treated with a complex of neurotrophic factors (BMP4 group and non-BMP4 group) were induced into auditory neuron-like cells, then the differences between the two groups were analyzed in morphological observation, cell growth curve, qRT-PCR, and immunofluorescence. Results: Flow cytometric analysis showed that the isolated cells expressed typical MSC surface markers. After adipogenic and osteogenic induction, the cells were stained by oil red O and Alizarin Red. The neuronal induced cells were in the growth plateau and had special forms of neurons. In the presence of BMP4, the inner ear genes NF-M, Neurog1, GluR4, NeuroD, Calretinin, NeuN, Tau, and GATA3 were up-regulated in MSCs. Conclusions: MSCs have the capacity to differentiate into auditory neuron-like cells in vitro. As an effective inducer, BMP4 may play a key role in transdifferentiation.},
  language  = {en}
}
@article{SchneiderKohlSauteretal.2012,
  author    = {Schneider, Tobias and Kohl, Benjamin and Sauter, Tilman and Kratz, Karl and Lendlein, Andreas and Ertel, Wolfgang and Schulze-Tanzil, Gundula},
  title     = {Influence of fiber orientation in electrospun polymer scaffolds on viability, adhesion and differentiation of articular chondrocytes},
  series = {Clinical hemorheology and microcirculation : blood flow and vessels},
  volume    = {52},
  journal   = {Clinical hemorheology and microcirculation : blood flow and vessels},
  number    = {2-4},
  publisher = {IOS Press},
  address   = {Amsterdam},
  issn      = {1386-0291},
  doi       = {10.3233/CH-2012-1608},
  pages     = {325 -- 336},
  year      = {2012},
  abstract  = {Degradable polymers with a tailorable degradation rate might be promising candidate materials for biomaterial-based cartilage repair. In view of the poor intrinsic healing capability of cartilage, implantation of autologous chondrocytes seeded on a biocompatible slow degrading polymer might be an encouraging approach to improve cartilage repair in the future. This study was undertaken to test if the fiber orientation (random versus aligned) of two different degradable polymers and a polymer intended for long term applications could influence primary articular chondrocytes growth and ultrastructure. A degradable copoly(ether) esterurethane (PDC) was synthesized via co-condensation of poly(p-dioxanone) diol and poly(epsilon-caprolactone) diol using an aliphatic diisocyanate as linker. Poly(p-dioxanone) (PPDO) was applied as commercially available degradable polymer, while polyetherimide (PEI) was chosen as biomaterial enabling surface functionalization. The fibrous scaffolds of PDC and PPDO were obtained by electrospinning using 1,1,1,3,3,3 hexafluoro-2-propanol (HFP), while for PEI dimethyl acetamide (DMAc) was applied as solvent. Primary porcine articular chondrocytes were seeded at different cell densities on the fibrous polymer scaffolds and analyzed for viability (fluorescein diacetate/ethidiumbromide staining), for type II collagen synthesis (immunolabelling), ultrastructure and orientation on the fibers (SEM: scanning electron microscopy). Vital chondrocytes adhered on all electrospun scaffolds irrespective of random and aligned topologies. In addition, the chondrocytes produced the cartilage-specific type II collagen on all tested polymer topologies suggesting their differentiated functions. SEM revealed an almost flattened chondrocytes shape on scaffolds with random fiber orientation: whereby chondrocytes growth remained mainly restricted to the scaffold surface. On aligned fibers the chondrocytes exhibited a more spindle-shaped morphology with rougher cell surfaces but only a minority of the cells aligned according to the fibers. As a next step the reduction of the fiber diameter of electrospun scaffolds should be addressed as an important parameter to mimic cartilage ECM structure.},
  language  = {en}
}