TY - JOUR A1 - Reil, Daniela A1 - Binder, Florian A1 - Freise, Jona A1 - Imholt, Christian A1 - Beyrers, Konrad A1 - Jacob, Jens A1 - Krüger, Detlev H. A1 - Hofmann, Jörg A1 - Dreesman, Johannes A1 - Ulrich, Rainer Günter T1 - Hantaviren in Deutschland BT - Aktuelle Erkenntnisse zu Erreger, Reservoir, Verbreitung und Prognosemodellen JF - Berliner und Münchener tierärztliche Wochenschrift N2 - Hantaviruses are small mammal-associated pathogens that are found in rodents but also in shrews, moles and bats. Aim of this manuscript is to give a current overview of the epidemiology and ecology of hantaviruses in Germany and to discuss respective models for the prediction of virus outbreaks. In Germany the majority of human disease cases are caused by the Puumala virus (PUUV), transmitted by the bank vole (Myodes glareolus). PUUV is associated with the Western evolutionary lineage of the bank vole and is not present in the eastern and northern parts of Germany. A second human pathogenic hantavirus is the Dobrava-Belgrade virus (DOBV), genotype Kurkino; its reservoir host, the striped field mouse (Apodemus agrarius), is mostly occurring in the eastern part of Germany. A PUUV-related hantavirus is the rarely pathogenic Tula virus (TULV), that is associated with the common vole (Microtus arvalis). In addition, Seewis virus, Asikkala virus, and Bruges virus are shrew- and mole-associated hantaviruses with still unknown pathogenicity in humans. Human disease cases are associated with the different hantaviruses according to their regional distribution. The viruses can cause mild to severe but also subclinical courses of the respective disease. The number of human PUUV disease cases in 2007, 2010, 2012, 2015 and 2017 correlates with the occurrence of high levels of seed production of beech trees ("beech mast") in the preceding year. Models based on weather parameters for the prediction of PUUV disease clusters as developed in recent years need further validation and optimisation. in addition to the abundance of infected reservoir rodents, the exposure behaviour of humans affects the risk of human infection. The application of robust forecast models can assist the public health service to develop and communicate spatially and temporally targeted information. Thus, further recommendations to mitigate infection risk for the public may be provided. N2 - Hantaviren sind Kleinsäuger-assoziierte Krankheitserreger, die vor allem in Nagetieren, aber auch in Spitzmäusen, Maulwürfen und Fledermäusen vorkommen. Ziel dieser Arbeit ist es, einen aktuellen Überblick zur Epidemiologie und Ökologie der Hantaviren in Deutschland zu geben und Modelle zur Vorhersage von Virusausbrüchen zu diskutieren. In Deutschland werden die meisten humanen Erkrankungsfälle beim Menschen durch das von der Rötelmaus (Myodes glareolus) übertragene Puumalavirus (PUUV) verursacht. PUUV ist mit der westlichen evolutionären Linie der Rötelmaus assoziiert und fehlt im östlichen und nördlichen Teil Deutschlands. Ein zweites humanpathogenes Hantavirus ist das Dobrava-Belgrad-Virus (DOBV), Genotyp Kurkino, dessen Reservoir die vor allem im östlichen Teil Deutschlands vorkommende Brandmaus (Apodemus agrarius) ist. Ein PUUV-verwandtes Hantavirus ist das selten humanpathogene Tulavirus (TULV), das mit der Feldmaus (Microtus arvalis) assoziiert ist. Darüber hinaus wurden mit dem Seewis-, Asikkala- und Brugesvirus Spitzmaus- und Maulwurf-assoziierte Hantaviren mit noch unklarer Humanpathogenität gefunden. Die humanen Erkrankungen sind jeweils mit den verschiedenen Hantaviren in deren regionaler Verteilung assoziiert und können mild bis schwer, aber auch subklinisch verlaufen. Das Auftreten von Häufungen humaner, durch PUUV verursachter Erkrankungen in den Jahren 2007, 2010, 2012, 2015 und 2017 korreliert mit dem Auftreten einer starken Fruktifikation der Buche („Buchenmast“) im jeweiligen Vorjahr. Auf der Basis von Wetterparametern sind Modelle zur Vorhersage von PUUV-Erkrankungshäufungen entwickelt worden, die zukünftig validiert und optimiert werden müssen. Neben dem Ausmaß des Virusvorkommens im Reservoir wird das Risiko humaner Infektionen durch das Expositionsverhalten des Menschen beeinflusst. Durch die Anwendung von Prognosemodellen soll der öffentliche Gesundheitsdienst in die Lage versetzt werden, räumlich und zeitlich gezielte und sachgerechte Präventionsempfehlungen für die Bevölkerung abzugeben. T2 - Hantaviruses in Germany: current knowledge on pathogens, reservoirs, distribution and forecast models KW - early warning system KW - hantavirus KW - hantavirus disease KW - rodents KW - population dynamics KW - Frühwarn-System KW - Hantavirus KW - Hantavirus-Erkrankung KW - Nagetiere KW - Populationsdynamik Y1 - 2018 U6 - https://doi.org/10.2376/0005-9366-18003 SN - 0005-9366 SN - 1439-0299 VL - 131 IS - 11-12 SP - 453 EP - 464 PB - Schlütersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG. CY - Hannover ER - TY - JOUR A1 - Müller, Jürgen A1 - Krüger, Jens A1 - Zeier, Alexander T1 - Unternehmensportale als Quelle für relevante Informationen JF - Handbuch prozessorientierters Wissensmanagment Y1 - 2014 SN - 978-3-95545-026-7 SP - 299 EP - 307 PB - GITO CY - Berlin ER - TY - THES A1 - Krüger, Jens T1 - Enterprise-specific in-memory data managment : HYRISEc - an in-memory column store engine for OLXP Y1 - 2014 PB - Hasso-Plattner-Insitut CY - Potsdam ER - TY - BOOK A1 - Schwalb, David A1 - Krüger, Jens A1 - Plattner, Hasso T1 - Cache conscious column organization in in-memory column stores N2 - Cost models are an essential part of database systems, as they are the basis of query performance optimization. Based on predictions made by cost models, the fastest query execution plan can be chosen and executed or algorithms can be tuned and optimised. In-memory databases shifts the focus from disk to main memory accesses and CPU costs, compared to disk based systems where input and output costs dominate the overall costs and other processing costs are often neglected. However, modelling memory accesses is fundamentally different and common models do not apply anymore. This work presents a detailed parameter evaluation for the plan operators scan with equality selection, scan with range selection, positional lookup and insert in in-memory column stores. Based on this evaluation, a cost model based on cache misses for estimating the runtime of the considered plan operators using different data structures is developed. Considered are uncompressed columns, bit compressed and dictionary encoded columns with sorted and unsorted dictionaries. Furthermore, tree indices on the columns and dictionaries are discussed. Finally, partitioned columns consisting of one partition with a sorted and one with an unsorted dictionary are investigated. New values are inserted in the unsorted dictionary partition and moved periodically by a merge process to the sorted partition. An efficient attribute merge algorithm is described, supporting the update performance required to run enterprise applications on read-optimised databases. Further, a memory traffic based cost model for the merge process is provided. N2 - Kostenmodelle sind ein essentieller Teil von Datenbanksystemen und bilden die Basis für Optimierungen von Ausführungsplänen. Durch Abschätzungen der Kosten können die entsprechend schnellsten Operatoren und Algorithmen zur Abarbeitung einer Anfrage ausgewählt und ausgeführt werden. Hauptspeicherresidente Datenbanken verschieben den Fokus von I/O Operationen hin zu Zugriffen auf den Hauptspeicher und CPU Kosten, verglichen zu Datenbanken deren primäre Kopie der Daten auf Sekundärspeicher liegt und deren Kostenmodelle sich in der Regel auf die kostendominierenden Zugriffe auf das Sekundärmedium beschränken. Kostenmodelle für Zugriffe auf Hauptspeicher unterscheiden sich jedoch fundamental von Kostenmodellen für Systeme basierend auf Festplatten, so dass alte Modelle nicht mehr greifen. Diese Arbeit präsentiert eine detaillierte Parameterdiskussion, sowie ein Kostenmodell basierend auf Cache-Zugriffen zum Abschätzen der Laufzeit von Datenbankoperatoren in spaltenorientierten und hauptspeicherresidenten Datenbanken wie das Selektieren von Werten einer Spalte mittels einer Gleichheitsbedingung oder eines Wertebereichs, das Nachschlagen der Werte einzelner Positionen oder dem Hinzufügen neuer Werte. Dabei werden Kostenfunktionen für die Operatoren erstellt, welche auf unkomprimierten Spalten, mittels Substitutionskompression komprimierten Spalten sowie bit-komprimierten Spalten operieren. Des Weiteren werden Baumstrukturen als Index Strukturen auf Spalten und Wörterbüchern in die Betrachtung gezogen. Abschließend werden partitionierte Spalten eingeführt, welche aus einer lese- und einer schreib-optimierten Partition bestehen. Neu Werte werden in die schreiboptimierte Partition eingefügt und periodisch von einem Attribut-Merge-Prozess mit der leseoptimierten Partition zusammengeführt. Beschrieben wird eine Effiziente Implementierung für den Attribut-Merge-Prozess und ein Hauptspeicher-bandbreitenbasiertes Kostenmodell aufgestellt. T3 - Technische Berichte des Hasso-Plattner-Instituts für Digital Engineering an der Universität Potsdam - 67 KW - Hauptspeicherdatenbank KW - Datenbank-Kostenmodell KW - Attribut-Merge-Prozess KW - In-Memory Database KW - Database Cost Model KW - Attribute Merge Process Y1 - 2013 U6 - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:kobv:517-opus-63890 SN - 978-3-86956-228-5 PB - Universitätsverlag Potsdam CY - Potsdam ER - TY - JOUR A1 - Fischer, Tomáš A1 - Hrubcova, Pavla A1 - Dahm, Torsten A1 - Woith, Heiko A1 - Vylita, Tomáš A1 - Ohrnberger, Matthias A1 - Vlček, Josef A1 - Horalek, Josef A1 - Dedecek, Petr A1 - Zimmer, Martin A1 - Lipus, Martin P. A1 - Pierdominici, Simona A1 - Kallmeyer, Jens A1 - Krüger, Frank A1 - Hannemann, Katrin A1 - Korn, Michael A1 - Kaempf, Horst A1 - Reinsch, Thomas A1 - Klicpera, Jakub A1 - Vollmer, Daniel A1 - Daskalopoulou, Kyriaki T1 - ICDP drilling of the Eger Rift observatory BT - magmatic fluids driving the earthquake swarms and deep biosphere JF - Scientific drilling : reports on deep earth sampling and monitoring N2 - The new in situ geodynamic laboratory established in the framework of the ICDP Eger project aims to develop the most modern, comprehensive, multiparameter laboratory at depth for studying earthquake swarms, crustal fluid flow, mantle-derived CO2 and helium degassing, and processes of the deep biosphere. In order to reach a new level of high-frequency, near-source and multiparameter observation of earthquake swarms and related phenomena, such a laboratory comprises a set of shallow boreholes with high-frequency 3-D seismic arrays as well as modern continuous real-time fluid monitoring at depth and the study of the deep biosphere. This laboratory is located in the western part of the Eger Rift at the border of the Czech Republic and Germany (in the West Bohemia–Vogtland geodynamic region) and comprises a set of five boreholes around the seismoactive zone. To date, all monitoring boreholes have been drilled. This includes the seismic monitoring boreholes S1, S2 and S3 in the crystalline units north and east of the major Nový Kostel seismogenic zone, borehole F3 in the Hartoušov mofette field and borehole S4 in the newly discovered Bažina maar near Libá. Supplementary borehole P1 is being prepared in the Neualbenreuth maar for paleoclimate and biological research. At each of these sites, a borehole broadband seismometer will be installed, and sites S1, S2 and S3 will also host a 3-D seismic array composed of a vertical geophone chain and surface seismic array. Seismic instrumenting has been completed in the S1 borehole and is in preparation in the remaining four monitoring boreholes. The continuous fluid monitoring site of Hartoušov includes three boreholes, F1, F2 and F3, and a pilot monitoring phase is underway. The laboratory also enables one to analyze microbial activity at CO2 mofettes and maar structures in the context of changes in habitats. The drillings into the maar volcanoes contribute to a better understanding of the Quaternary paleoclimate and volcanic activity. Y1 - 2022 U6 - https://doi.org/10.5194/sd-31-31-2022 SN - 1816-8957 SN - 1816-3459 VL - 31 SP - 31 EP - 49 PB - Copernicus CY - Göttingen ER - TY - JOUR A1 - Fischer, Tomas A1 - Hrubcova, Pavla A1 - Dahm, Torsten A1 - Woith, Heiko A1 - Vylita, Tomas A1 - Ohrnberger, Matthias A1 - Vlcek, Josef A1 - Horalek, Josef A1 - Dedecek, Petr A1 - Zimmer, Martin A1 - Lipus, Martin P. A1 - Pierdominici, Simona A1 - Kallmeyer, Jens A1 - Krüger, Frank A1 - Hannemann, Katrin A1 - Korn, Michael A1 - Kämpf, Horst A1 - Reinsch, Thomas A1 - Klicpera, Jakub A1 - Vollmer, Daniel A1 - Daskalopoulou, Kyriaki T1 - ICDP drilling of the Eger Rift observatory BT - magmatic fluids driving the earthquake swarms and deep biosphere JF - Scientific Drilling N2 - The new in situ geodynamic laboratory established in the framework of the ICDP Eger project aims to develop the most modern, comprehensive, multiparameter laboratory at depth for studying earthquake swarms, crustal fluid flow, mantle-derived CO2 and helium degassing, and processes of the deep biosphere. In order to reach a new level of high-frequency, near-source and multiparameter observation of earthquake swarms and related phenomena, such a laboratory comprises a set of shallow boreholes with high-frequency 3-D seismic arrays as well as modern continuous real-time fluid monitoring at depth and the study of the deep biosphere. This laboratory is located in the western part of the Eger Rift at the border of the Czech Republic and Germany (in the West Bohemia-Vogtland geodynamic region) and comprises a set of five boreholes around the seismoactive zone. To date, all monitoring boreholes have been drilled. This includes the seismic monitoring boreholes S1, S2 and S3 in the crystalline units north and east of the major Novy Kostel seismogenic zone, borehole F3 in the Hartousov mofette field and borehole S4 in the newly discovered Bazina maar near Liba. Supplementary borehole P1 is being prepared in the Neualbenreuth maar for paleoclimate and biological research. At each of these sites, a borehole broadband seismometer will be installed, and sites S1, S2 and S3 will also host a 3-D seismic array composed of a vertical geophone chain and surface seismic array. Seismic instrumenting has been completed in the S1 borehole and is in preparation in the remaining four monitoring boreholes. The continuous fluid monitoring site of Hartousov includes three boreholes, F1, F2 and F3, and a pilot monitoring phase is underway. The laboratory also enables one to analyze microbial activity at CO2 mofettes and maar structures in the context of changes in habitats. The drillings into the maar volcanoes contribute to a better understanding of the Quaternary paleoclimate and volcanic activity. Y1 - 2022 U6 - https://doi.org/10.5194/sd-31-31-2022 SN - 1816-8957 SN - 1816-3459 VL - 31 SP - 31 EP - 49 PB - Copernicus CY - Göttingen ER -