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A1  - Rodriguez Vazquez, J. J.
A1  - Romano, Patrizia
A1  - Romeo, G.
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A1  - Schioppa, E. J.
A1  - Schoorlemmer, H.
A1  - Schovanek, P.
A1  - Schussler, F.
A1  - Sergijenko, O.
A1  - Servillat, M.
A1  - Shalchi, A.
A1  - Shellard, R. C.
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A1  - Sillanpaa, A.
A1  - Simone, D.
A1  - Sliusar, V.
A1  - Sol, H.
A1  - Stanic, S.
A1  - Starling, R.
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A1  - Stefanik, S.
A1  - Stephan, M.
A1  - Stolarczyk, T.
A1  - Szanecki, M.
A1  - Szepieniec, T.
A1  - Tagliaferri, G.
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A1  - Takahashi, M.
A1  - Takeda, J.
A1  - Tanaka, M.
A1  - Tanaka, S.
A1  - Tejedor, L. A.
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A1  - Temnikov, P.
A1  - Terada, Y.
A1  - Tescaro, D.
A1  - Teshima, M.
A1  - Testa, V.
A1  - Thoudam, S.
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A1  - Torres, D. F.
A1  - Torresi, E.
A1  - Tosti, G.
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A1  - Valore, L.
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A1  - Vandenbroucke, Justin
A1  - Vassiliev, V.
A1  - Vecchi, M.
A1  - Vercellone, Stefano
A1  - Vergani, S.
A1  - Vigorito, C.
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A1  - Vrastil, M.
A1  - Vazquez Acosta, M. L.
A1  - Wagner, S. J.
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A1  - Wakely, S. P.
A1  - Walter, R.
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A1  - Watson, J. J.
A1  - Weinstein, A.
A1  - White, M.
A1  - White, R.
A1  - Wierzcholska, A.
A1  - Wilcox, P.
A1  - Williams, D. A.
A1  - Wischnewski, R.
A1  - Wojcik, P.
A1  - Yamamoto, T.
A1  - Yamamoto, H.
A1  - Yamazaki, Ryo
A1  - Yanagita, S.
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A1  - Yoshida, T.
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A1  - Yoshiike, S.
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A1  - Zacharias, M.
A1  - Zampieri, L.
A1  - Zanin, R.
A1  - Zavrtanik, M.
A1  - Zavrtanik, D.
A1  - Zdziarski, A.
A1  - Zech, Alraune
A1  - Zechlin, Hannes
A1  - Zhdanov, V.
A1  - Ziegler, A.
A1  - Zorn, J.
T1  - Prospects for Cherenkov Telescope Array Observations of the Young Supernova Remnant RX J1713.7-3946
JF  - The astrophysical journal : an international review of spectroscopy and astronomical physics
N2  - We perform simulations for future Cherenkov Telescope Array (CTA) observations of RX J1713.7-3946, a young supernova remnant (SNR) and one of the brightest sources ever discovered in very high energy (VHE) gamma rays. Special attention is paid to exploring possible spatial (anti) correlations of gamma rays with emission at other wavelengths, in particular X-rays and CO/H I emission. We present a series of simulated images of RX J1713.7-3946 for CTA based on a set of observationally motivated models for the gamma-ray emission. In these models, VHE gamma rays produced by high-energy electrons are assumed to trace the nonthermal X-ray emission observed by XMM-Newton, whereas those originating from relativistic protons delineate the local gas distributions. The local atomic and molecular gas distributions are deduced by the NANTEN team from CO and H I observations. Our primary goal is to show how one can distinguish the emission mechanism(s) of the gamma rays (i.e., hadronic versus leptonic, or a mixture of the two) through information provided by their spatial distribution, spectra, and time variation. This work is the first attempt to quantitatively evaluate the capabilities of CTA to achieve various proposed scientific goals by observing this important cosmic particle accelerator.
KW  - cosmic rays
KW  - gamma rays: ISM
KW  - ISM: individual objects (RX J1713.7-3946, G347.3-0.5)
Y1  - 2017
U6  - https://doi.org/10.3847/1538-4357/aa6d67
SN  - 0004-637X
SN  - 1538-4357
VL  - 840
IS  - 2
PB  - IOP Publ. Ltd.
CY  - Bristol
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Zbilut, J. P.
A1  - Giuliani, A.
A1  - Colosimo, A.
A1  - Mitchell, J. C.
A1  - Colafranceschi, M.
A1  - Marwan, Norbert
A1  - Webber, C. L.
A1  - Uversky, V. N.
T1  - Charge and hydrophobicity patterning along the sequence predicts the folding mechanism and aggregation of proteins : a computational approach
N2  - The presence of partially folded intermediates along the folding funnel of proteins has been suggested to be a signature of potentially aggregating systems. Many studies have concluded that metastable, highly flexible intermediates are the basic elements of the aggregation process. In a previous paper, we demonstrated how the choice between aggregation and folding behavior was influenced by hydrophobicity distribution patterning along the sequence, as quantified by recurrence quantification analysis (RQA) of the Myiazawa-Jernigan coded primary structures. In the present paper, we tried to unify the "partially folded intermediate" and "hydrophobicity/charge" models of protein aggregation verifying the ability of an empirical relation, developed for rationalizing the effect of different mutations on aggregation propensity of acyl-phosphatase and based on the combination of hydrophobicity RQA and charge descriptors, to discriminate in a statistically significant way two different protein populations: (a) proteins that fold by a process passing by partially folded intermediates and (b) proteins that do not present partially folded intermediates
Y1  - 2004
SN  - 1535-3893
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Zbilut, J. P.
A1  - Mitchell, J. C.
A1  - Giuliani, A.
A1  - Colosimo, A.
A1  - Marwan, Norbert
A1  - Webber, C. L.
T1  - Singular hydrophobicity patterns and net charge : a mesoscopic principle for protein aggregation/folding
N2  - A statistical model describing the propensity for protein aggregation is presented. Only amino-acid hydrophobicity values and calculated net charge are used for the model. The combined effects of hydrophobic patterns as computed by the signal analysis technique, recurrence quantification, plus calculated net charge were included in a function emphasizing the effect of singular hydrophobic patches which were found to be statistically significant for predicting aggregation propensity as quantified by fluorescence studies obtained from the literature. These results suggest preliminary evidence for a mesoscopic principle for protein folding/aggregation. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved
Y1  - 2004
SN  - 0378-4371
ER  -