TY - JOUR A1 - Rohrmann, Johannes A1 - Tohge, Takayuki A1 - Alba, Rob A1 - Osorio, Sonia A1 - Caldana, Camila A1 - McQuinn, Ryan A1 - Arvidsson, Samuel Janne A1 - van der Merwe, Margaretha J. A1 - Riano-Pachon, Diego Mauricio A1 - Müller-Röber, Bernd A1 - Fei, Zhangjun A1 - Nesi, Adriano Nunes A1 - Giovannoni, James J. A1 - Fernie, Alisdair R. T1 - Combined transcription factor profiling, microarray analysis and metabolite profiling reveals the transcriptional control of metabolic shifts occurring during tomato fruit development JF - The plant journal N2 - Maturation of fleshy fruits such as tomato (Solanum lycopersicum) is subject to tight genetic control. Here we describe the development of a quantitative real-time PCR platform that allows accurate quantification of the expression level of approximately 1000 tomato transcription factors. In addition to utilizing this novel approach, we performed cDNA microarray analysis and metabolite profiling of primary and secondary metabolites using GC-MS and LC-MS, respectively. We applied these platforms to pericarp material harvested throughout fruit development, studying both wild-type Solanum lycopersicum cv. Ailsa Craig and the hp1 mutant. This mutant is functionally deficient in the tomato homologue of the negative regulator of the light signal transduction gene DDB1 from Arabidopsis, and is furthermore characterized by dramatically increased pigment and phenolic contents. We choose this particular mutant as it had previously been shown to have dramatic alterations in the content of several important fruit metabolites but relatively little impact on other ripening phenotypes. The combined dataset was mined in order to identify metabolites that were under the control of these transcription factors, and, where possible, the respective transcriptional regulation underlying this control. The results are discussed in terms of both programmed fruit ripening and development and the transcriptional and metabolic shifts that occur in parallel during these processes. KW - transcription factor KW - Solanum lycopersicum KW - quantitative RT-PCR KW - microarray KW - metabolomics KW - fleshy fruit ripening Y1 - 2011 U6 - https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2011.04750.x SN - 0960-7412 VL - 68 IS - 6 SP - 999 EP - 1013 PB - Wiley-Blackwell CY - Malden ER - TY - JOUR A1 - Actis, M. A1 - Agnetta, G. A1 - Aharonian, Felix A. A1 - Akhperjanian, A. G. A1 - Aleksic, J. A1 - Aliu, E. A1 - Allan, D. A1 - Allekotte, I. A1 - Antico, F. A1 - Antonelli, L. A. A1 - Antoranz, P. A1 - Aravantinos, A. A1 - Arlen, T. A1 - Arnaldi, H. A1 - Artmann, S. A1 - Asano, K. A1 - Asorey, H. G. A1 - Baehr, J. A1 - Bais, A. A1 - Baixeras, C. A1 - Bajtlik, S. A1 - Balis, D. A1 - Bamba, A. A1 - Barbier, C. A1 - Barcelo, M. A1 - Barnacka, Anna A1 - Barnstedt, Jürgen A1 - de Almeida, U. Barres A1 - Barrio, J. A. A1 - Basso, S. A1 - Bastieri, D. A1 - Bauer, C. A1 - Becerra Gonzalez, J. A1 - Becherini, Yvonne A1 - Bechtol, K. C. A1 - Becker, J. A1 - Beckmann, Volker A1 - Bednarek, W. A1 - Behera, B. A1 - Beilicke, M. A1 - Belluso, M. A1 - Benallou, M. A1 - Benbow, W. A1 - Berdugo, J. A1 - Berger, K. A1 - Bernardino, T. A1 - Bernlöhr, K. A1 - Biland, A. A1 - Billotta, S. A1 - Bird, T. A1 - Birsin, E. A1 - Bissaldi, E. A1 - Blake, S. A1 - Blanch Bigas, O. A1 - Bobkov, A. A. A1 - Bogacz, L. A1 - Bogdan, M. A1 - Boisson, Catherine A1 - Boix Gargallo, J. A1 - Bolmont, J. A1 - Bonanno, G. A1 - Bonardi, A. A1 - Bonev, T. A1 - Borkowski, Janett A1 - Botner, O. A1 - Bottani, A. A1 - Bourgeat, M. A1 - Boutonnet, C. A1 - Bouvier, A. A1 - Brau-Nogue, S. A1 - Braun, I. A1 - Bretz, T. A1 - Briggs, M. S. A1 - Brun, Pierre A1 - Brunetti, L. A1 - Buckley, H. A1 - Bugaev, V. A1 - Buehler, R. A1 - Bulik, Tomasz A1 - Busetto, G. A1 - Buson, S. A1 - Byrum, K. A1 - Cailles, M. A1 - Cameron, R. A. A1 - Canestrari, R. A1 - Cantu, S. A1 - Carmona, E. A1 - Carosi, A. A1 - Carr, John A1 - Carton, P. H. A1 - Casiraghi, M. A1 - Castarede, H. A1 - Catalano, O. A1 - Cavazzani, S. A1 - Cazaux, S. A1 - Cerruti, B. A1 - Cerruti, M. A1 - Chadwick, M. A1 - Chiang, J. A1 - Chikawa, M. A1 - Cieslar, M. A1 - Ciesielska, M. A1 - Cillis, A. N. A1 - Clerc, C. A1 - Colin, P. A1 - Colome, J. A1 - Compin, M. A1 - Conconi, P. A1 - Connaughton, V. A1 - Conrad, Jan A1 - Contreras, J. L. A1 - Coppi, P. A1 - Corlier, M. A1 - Corona, P. A1 - Corpace, O. A1 - Corti, D. A1 - Cortina, J. A1 - Costantini, H. A1 - Cotter, G. A1 - Courty, B. A1 - Couturier, S. A1 - Covino, S. A1 - Croston, J. A1 - Cusumano, G. A1 - Daniel, M. K. A1 - Dazzi, F. A1 - Deangelis, A. A1 - de Cea del Pozo, E. A1 - Dal Pino, E. M. de Gouveia A1 - de Jager, O. A1 - de la Calle Perez, I. A1 - De La Vega, G. A1 - De Lotto, B. A1 - de Naurois, M. A1 - Wilhelmi, E. de Ona A1 - de Souza, V. A1 - Decerprit, B. A1 - Deil, C. A1 - Delagnes, E. A1 - Deleglise, G. A1 - Delgado, C. A1 - Dettlaff, T. A1 - Di Paolo, A. A1 - Di Pierro, F. A1 - Diaz, C. A1 - Dick, J. A1 - Dickinson, H. A1 - Digel, S. W. A1 - Dimitrov, D. A1 - Disset, G. A1 - Djannati-Ataï, A. A1 - Doert, M. A1 - Domainko, W. A1 - Dorner, D. A1 - Doro, M. A1 - Dournaux, J. -L. A1 - Dravins, D. A1 - Drury, L. A1 - Dubois, F. A1 - Dubois, R. A1 - Dubus, G. A1 - Dufour, C. A1 - Durand, D. A1 - Dyks, J. A1 - Dyrda, M. A1 - Edy, E. A1 - Egberts, Kathrin A1 - Eleftheriadis, C. A1 - Elles, S. A1 - Emmanoulopoulos, D. A1 - Enomoto, R. A1 - Ernenwein, J. -P. A1 - Errando, M. A1 - Etchegoyen, A. A1 - Falcone, A. D. A1 - Farakos, K. A1 - Farnier, C. A1 - Federici, S. A1 - Feinstein, F. A1 - Ferenc, D. A1 - Fillin-Martino, E. A1 - Fink, D. A1 - Finley, C. A1 - Finley, J. P. A1 - Firpo, R. A1 - Florin, D. A1 - Foehr, C. A1 - Fokitis, E. A1 - Font, Ll. A1 - Fontaine, G. A1 - Fontana, A. A1 - Foerster, A. A1 - Fortson, L. A1 - Fouque, N. A1 - Fransson, C. A1 - Fraser, G. W. A1 - Fresnillo, L. A1 - Fruck, C. A1 - Fujita, Y. A1 - Fukazawa, Y. A1 - Funk, S. A1 - Gaebele, W. A1 - Gabici, S. A1 - Gadola, A. A1 - Galante, N. A1 - Gallant, Y. A1 - Garcia, B. A1 - Garcia Lopez, R. J. A1 - Garrido, D. A1 - Garrido, L. A1 - Gascon, D. A1 - Gasq, C. A1 - Gaug, M. A1 - Gaweda, J. A1 - Geffroy, N. A1 - Ghag, C. A1 - Ghedina, A. A1 - Ghigo, M. A1 - Gianakaki, E. A1 - Giarrusso, S. A1 - Giavitto, G. A1 - Giebels, B. A1 - Giro, E. A1 - Giubilato, P. A1 - Glanzman, T. A1 - Glicenstein, J. -F. A1 - Gochna, M. A1 - Golev, V. A1 - Gomez Berisso, M. A1 - Gonzalez, A. A1 - Gonzalez, F. A1 - Granena, F. A1 - Graciani, R. A1 - Granot, J. A1 - Gredig, R. A1 - Green, A. A1 - Greenshaw, T. A1 - Grimm, O. A1 - Grube, J. A1 - Grudzinska, M. A1 - Grygorczuk, J. A1 - Guarino, V. A1 - Guglielmi, L. A1 - Guilloux, F. A1 - Gunji, S. A1 - Gyuk, G. A1 - Hadasch, D. A1 - Haefner, D. A1 - Hagiwara, R. A1 - Hahn, J. A1 - Hallgren, A. A1 - Hara, S. A1 - Hardcastle, M. J. A1 - Hassan, T. A1 - Haubold, T. A1 - Hauser, M. A1 - Hayashida, M. A1 - Heller, R. A1 - Henri, G. A1 - Hermann, G. A1 - Herrero, A. A1 - Hinton, James Anthony A1 - Hoffmann, D. A1 - Hofmann, W. A1 - Hofverberg, P. A1 - Horns, D. A1 - Hrupec, D. A1 - Huan, H. A1 - Huber, B. A1 - Huet, J. -M. A1 - Hughes, G. A1 - Hultquist, K. A1 - Humensky, T. B. A1 - Huppert, J. -F. A1 - Ibarra, A. A1 - Illa, J. M. A1 - Ingjald, J. A1 - Inoue, S. A1 - Inoue, Y. A1 - Ioka, K. A1 - Jablonski, C. A1 - Jacholkowska, A. A1 - Janiak, M. A1 - Jean, P. A1 - Jensen, H. A1 - Jogler, T. A1 - Jung, I. A1 - Kaaret, P. A1 - Kabuki, S. A1 - Kakuwa, J. A1 - Kalkuhl, C. A1 - Kankanyan, R. A1 - Kapala, M. A1 - Karastergiou, A. A1 - Karczewski, M. A1 - Karkar, S. A1 - Karlsson, N. A1 - Kasperek, J. A1 - Katagiri, H. A1 - Katarzynski, K. A1 - Kawanaka, N. A1 - Kedziora, B. A1 - Kendziorra, E. A1 - Khelifi, B. A1 - Kieda, D. A1 - Kifune, T. A1 - Kihm, T. A1 - Klepser, S. A1 - Kluzniak, W. A1 - Knapp, J. A1 - Knappy, A. R. A1 - Kneiske, T. A1 - Knoedlseder, J. A1 - Koeck, F. A1 - Kodani, K. A1 - Kohri, K. A1 - Kokkotas, K. A1 - Komin, N. A1 - Konopelko, A. A1 - Kosack, K. A1 - Kossakowski, R. A1 - Kostka, P. A1 - Kotula, J. A1 - Kowal, G. A1 - Koziol, J. A1 - Kraehenbuehl, T. A1 - Krause, J. A1 - Krawczynski, H. A1 - Krennrich, F. A1 - Kretzschmann, A. A1 - Kubo, H. A1 - Kudryavtsev, V. A. A1 - Kushida, J. A1 - La Barbera, N. A1 - La Parola, V. A1 - La Rosa, G. A1 - Lopez, A. A1 - Lamanna, G. A1 - Laporte, P. A1 - Lavalley, C. A1 - Le Flour, T. A1 - Le Padellec, A. A1 - Lenain, J. -P. A1 - Lessio, L. A1 - Lieunard, B. A1 - Lindfors, E. A1 - Liolios, A. A1 - Lohse, T. A1 - Lombardi, S. A1 - Lopatin, A. A1 - Lorenz, E. A1 - Lubinski, P. A1 - Luz, O. A1 - Lyard, E. A1 - Maccarone, M. C. A1 - Maccarone, T. A1 - Maier, G. A1 - Majumdar, P. A1 - Maltezos, S. A1 - Malkiewicz, P. A1 - Mana, C. A1 - Manalaysay, A. A1 - Maneva, G. A1 - Mangano, A. A1 - Manigot, P. A1 - Marin, J. A1 - Mariotti, M. A1 - Markoff, S. A1 - Martinez, G. A1 - Martinez, M. A1 - Mastichiadis, A. A1 - Matsumoto, H. A1 - Mattiazzo, S. A1 - Mazin, D. A1 - McComb, T. J. L. A1 - McCubbin, N. A1 - McHardy, I. A1 - Medina, C. A1 - Melkumyan, D. A1 - Mendes, A. A1 - Mertsch, P. A1 - Meucci, M. A1 - Michalowski, J. A1 - Micolon, P. A1 - Mineo, T. A1 - Mirabal, N. A1 - Mirabel, F. A1 - Miranda, J. M. A1 - Mirzoyan, R. A1 - Mizuno, T. A1 - Moal, B. A1 - Moderski, R. A1 - Molinari, E. A1 - Monteiro, I. A1 - Moralejo, A. A1 - Morello, C. A1 - Mori, K. A1 - Motta, G. A1 - Mottez, F. A1 - Moulin, Emmanuel A1 - Mukherjee, R. A1 - Munar, P. A1 - Muraishi, H. A1 - Murase, K. A1 - Murphy, A. Stj. A1 - Nagataki, S. A1 - Naito, T. A1 - Nakamori, T. A1 - Nakayama, K. A1 - Naumann, C. L. A1 - Naumann, D. A1 - Nayman, P. A1 - Nedbal, D. A1 - Niedzwiecki, A. A1 - Niemiec, J. A1 - Nikolaidis, A. A1 - Nishijima, K. A1 - Nolan, S. J. A1 - Nowak, N. A1 - O'Brien, P. T. A1 - Ochoa, I. A1 - Ohira, Y. A1 - Ohishi, M. A1 - Ohka, H. A1 - Okumura, A. A1 - Olivetto, C. A1 - Ong, R. A. A1 - Orito, R. A1 - Orr, M. A1 - Osborne, J. P. A1 - Ostrowski, M. A1 - Otero, L. A1 - Otte, A. N. A1 - Ovcharov, E. A1 - Oya, I. A1 - Ozieblo, A. A1 - Paiano, S. A1 - Pallota, J. A1 - Panazol, J. L. A1 - Paneque, D. A1 - Panter, M. A1 - Paoletti, R. A1 - Papyan, G. A1 - Paredes, J. M. A1 - Pareschi, G. A1 - Parsons, R. D. A1 - Arribas, M. Paz A1 - Pedaletti, G. A1 - Pepato, A. A1 - Persic, M. A1 - Petrucci, P. O. A1 - Peyaud, B. A1 - Piechocki, W. A1 - Pita, S. A1 - Pivato, G. A1 - Platos, L. A1 - Platzer, R. A1 - Pogosyan, L. A1 - Pohl, Martin A1 - Pojmanski, G. A1 - Ponz, J. D. A1 - Potter, W. A1 - Prandini, E. A1 - Preece, R. A1 - Prokoph, H. A1 - Puehlhofer, G. A1 - Punch, M. A1 - Quel, E. A1 - Quirrenbach, A. A1 - Rajda, P. A1 - Rando, R. A1 - Rataj, M. A1 - Raue, M. A1 - Reimann, C. A1 - Reimann, O. A1 - Reimer, A. A1 - Reimer, O. A1 - Renaud, M. A1 - Renner, S. A1 - Reymond, J. -M. A1 - Rhode, W. A1 - Ribo, M. A1 - Ribordy, M. A1 - Rico, J. A1 - Rieger, F. A1 - Ringegni, P. A1 - Ripken, J. A1 - Ristori, P. A1 - Rivoire, S. A1 - Rob, L. A1 - Rodriguez, S. A1 - Roeser, U. A1 - Romano, Patrizia A1 - Romero, G. E. A1 - Rosier-Lees, S. A1 - Rovero, A. C. A1 - Roy, F. A1 - Royer, S. A1 - Rudak, B. A1 - Rulten, C. B. A1 - Ruppel, J. A1 - Russo, F. A1 - Ryde, F. A1 - Sacco, B. A1 - Saggion, A. A1 - Sahakian, V. A1 - Saito, K. A1 - Saito, T. A1 - Sakaki, N. A1 - Salazar, E. A1 - Salini, A. A1 - Sanchez, F. A1 - Sanchez Conde, M. A. A1 - Santangelo, Andrea A1 - Santos, E. M. A1 - Sanuy, A. A1 - Sapozhnikov, L. A1 - Sarkar, S. A1 - Scalzotto, V. A1 - Scapin, V. A1 - Scarcioffolo, M. A1 - Schanz, T. A1 - Schlenstedt, S. A1 - Schlickeiser, R. A1 - Schmidt, T. A1 - Schmoll, J. A1 - Schroedter, M. A1 - Schultz, C. A1 - Schultze, J. A1 - Schulz, A. A1 - Schwanke, U. A1 - Schwarzburg, S. A1 - Schweizer, T. A1 - Seiradakis, J. A1 - Selmane, S. A1 - Seweryn, K. A1 - Shayduk, M. A1 - Shellard, R. C. A1 - Shibata, T. A1 - Sikora, M. A1 - Silk, J. A1 - Sillanpaa, A. A1 - Sitarek, J. A1 - Skole, C. A1 - Smith, N. A1 - Sobczynska, D. A1 - Sofo Haro, M. A1 - Sol, H. A1 - Spanier, F. A1 - Spiga, D. A1 - Spyrou, S. A1 - Stamatescu, V. A1 - Stamerra, A. A1 - Starling, R. L. C. A1 - Stawarz, L. A1 - Steenkamp, R. A1 - Stegmann, Christian A1 - Steiner, S. A1 - Stergioulas, N. A1 - Sternberger, R. A1 - Stinzing, F. A1 - Stodulski, M. A1 - Straumann, U. A1 - Suarez, A. A1 - Suchenek, M. A1 - Sugawara, R. A1 - Sulanke, K. H. A1 - Sun, S. A1 - Supanitsky, A. D. A1 - Sutcliffe, P. A1 - Szanecki, M. A1 - Szepieniec, T. A1 - Szostek, A. A1 - Szymkowiak, A. A1 - Tagliaferri, G. A1 - Tajima, H. A1 - Takahashi, H. A1 - Takahashi, K. A1 - Takalo, L. A1 - Takami, H. A1 - Talbot, R. G. A1 - Tam, P. H. A1 - Tanaka, M. A1 - Tanimori, T. A1 - Tavani, M. A1 - Tavernet, J. -P. A1 - Tchernin, C. A1 - Tejedor, L. A. A1 - Telezhinsky, Igor O. A1 - Temnikov, P. A1 - Tenzer, C. A1 - Terada, Y. A1 - Terrier, R. A1 - Teshima, M. A1 - Testa, V. A1 - Tibaldo, L. A1 - Tibolla, O. A1 - Tluczykont, M. A1 - Peixoto, C. J. Todero A1 - Tokanai, F. A1 - Tokarz, M. A1 - Toma, K. A1 - Torres, D. F. A1 - Tosti, G. A1 - Totani, T. A1 - Toussenel, F. A1 - Vallania, P. A1 - Vallejo, G. A1 - van der Walt, J. A1 - van Eldik, C. A1 - Vandenbroucke, J. A1 - Vankov, H. A1 - Vasileiadis, G. A1 - Vassiliev, V. V. A1 - Vegas, I. A1 - Venter, L. A1 - Vercellone, S. A1 - Veyssiere, C. A1 - Vialle, J. P. A1 - Videla, M. A1 - Vincent, P. A1 - Vink, J. A1 - Vlahakis, N. A1 - Vlahos, L. A1 - Vogler, P. A1 - Vollhardt, A. A1 - Volpe, F. A1 - Von Gunten, H. P. A1 - Vorobiov, S. A1 - Wagner, S. A1 - Wagner, R. M. A1 - Wagner, B. A1 - Wakely, S. P. A1 - Walter, P. A1 - Walter, R. A1 - Warwick, R. A1 - Wawer, P. A1 - Wawrzaszek, R. A1 - Webb, N. A1 - Wegner, P. A1 - Weinstein, A. A1 - Weitzel, Q. A1 - Welsing, R. A1 - Wetteskind, H. A1 - White, R. A1 - Wierzcholska, A. A1 - Wilkinson, M. I. A1 - Williams, D. A. A1 - Winde, M. A1 - Wischnewski, R. A1 - Wisniewski, L. A1 - Wolczko, A. A1 - Wood, M. A1 - Xiong, Q. A1 - Yamamoto, T. A1 - Yamaoka, K. A1 - Yamazaki, R. A1 - Yanagita, S. A1 - Yoffo, B. A1 - Yonetani, M. A1 - Yoshida, A. A1 - Yoshida, T. A1 - Yoshikoshi, T. A1 - Zabalza, V. A1 - Zagdanski, A. A1 - Zajczyk, A. A1 - Zdziarski, A. A1 - Zech, Alraune A1 - Zietara, K. A1 - Ziolkowski, P. A1 - Zitelli, V. A1 - Zychowski, P. T1 - Design concepts for the Cherenkov Telescope Array CTA an advanced facility for ground-based high-energy gamma-ray astronomy JF - Experimental astronomy : an international journal on astronomical instrumentation and data analysis N2 - Ground-based gamma-ray astronomy has had a major breakthrough with the impressive results obtained using systems of imaging atmospheric Cherenkov telescopes. Ground-based gamma-ray astronomy has a huge potential in astrophysics, particle physics and cosmology. CTA is an international initiative to build the next generation instrument, with a factor of 5-10 improvement in sensitivity in the 100 GeV-10 TeV range and the extension to energies well below 100 GeV and above 100 TeV. CTA will consist of two arrays (one in the north, one in the south) for full sky coverage and will be operated as open observatory. The design of CTA is based on currently available technology. This document reports on the status and presents the major design concepts of CTA. KW - Ground based gamma ray astronomy KW - Next generation Cherenkov telescopes KW - Design concepts Y1 - 2011 U6 - https://doi.org/10.1007/s10686-011-9247-0 SN - 0922-6435 SN - 1572-9508 VL - 32 IS - 3 SP - 193 EP - 316 PB - Springer CY - Dordrecht ER - TY - JOUR A1 - Belova, Valentina A1 - Shchukin, Dmitry G. A1 - Gorin, Dmitry A. A1 - Kopyshev, Alexey A1 - Moehwald, Helmuth T1 - A new approach to nucleation of cavitation bubbles at chemically modified surfaces JF - Physical chemistry, chemical physics : a journal of European Chemical Societies N2 - Cavitation at the solid surface normally begins with nucleation, in which defects or assembled molecules located at a liquid-solid interface act as nucleation centers and are actively involved in the evolution of cavitation bubbles. Here, we propose a simple approach to evaluate the behavior of cavitation bubbles formed under high intensity ultrasound (20 kHz, 51.3 W cm (2)) at solid surfaces, based on sonication of patterned substrates with a small roughness (less than 3 nm) and controllable surface energy. A mixture of octadecylphosphonic acid (ODTA) and octadecanethiol (ODT) was stamped on the Si wafer coated with different thicknesses of an aluminium layer (20-500 nm). We investigated the growth mechanism of cavitation bubble nuclei and the evolution of individual pits (defects) formed under sonication on the modified surface. A new activation behavior as a function of Al thickness, sonication time, ultrasonic power and temperature is reported. In this process cooperativity is introduced, as initially formed pits further reduce the energy to form bubbles. Furthermore, cavitation on the patterns is a controllable process, where up to 40-50 min of sonication time only the hydrophobic areas are active nucleation sites. This study provides a convincing proof of our theoretical approach on nucleation. Y1 - 2011 U6 - https://doi.org/10.1039/c1cp20218a SN - 1463-9076 VL - 13 IS - 17 SP - 8015 EP - 8023 PB - Royal Society of Chemistry CY - Cambridge ER -