@misc{DasGuptaRoeschHochreinetal.2019,
  author    = {Das Gupta, Mainak and Roesch, Florian and Hochrein, Lena and Machens, Fabian and M{\"u}ller-R{\"o}ber, Bernd},
  title     = {Facilitating Genome Engineering Through RNP-mediated Precise Gene Targeting},
  series = {In Vitro Cellular \& Developmental Biology - Plant},
  volume    = {55},
  journal   = {In Vitro Cellular \& Developmental Biology - Plant},
  number    = {4},
  publisher = {Springer},
  address   = {New York},
  issn      = {1054-5476},
  pages     = {481 -- 481},
  year      = {2019},
  language  = {en}
}
@phdthesis{Hochrein2017,
  author    = {Hochrein, Lena},
  title     = {Development of a new DNA-assembly method and its application for the establishment of a red light-sensing regulation system},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:517-opus4-404441},
  school      = {Universit{\"a}t Potsdam},
  pages     = {146},
  year      = {2017},
  abstract  = {In der hier vorgelegten Doktorarbeit wurde eine Strategie zur schnellen, einfachen und zuverl{\"a}ssigen Assemblierung von DNS-Fragmenten, genannt AssemblX, entwickelt. Diese kann genutzt werden, um komplexe DNS-Konstrukte, wie beispielsweise komplette Biosynthesewege, aufzubauen. Dies dient der Produktion von technisch oder medizinisch relevanten Produkten in biotechnologisch nutzbaren Organismen. Die Vorteile der Klonierungsstrategie liegen in der Schnelligkeit der Klonierung, der Flexibilit{\"a}t bez{\"u}glich des Wirtsorganismus, sowie der hohen Effektivit{\"a}t, die durch gezielte Optimierung erreicht wurde. Die entwickelte Technik erlaubt die nahtlose Assemblierung von Genfragmenten und bietet eine Komplettl{\"o}sung von der Software-gest{\"u}tzten Planung bis zur Fertigstellung von DNS-Konstrukten, welche die Gr{\"o}ße von Mini-Chromosomen erreichen k{\"o}nnen. Mit Hilfe der oben beschriebenen AssemblX Strategie wurde eine optogenetische Plattform f{\"u}r die B{\"a}ckerhefe Saccharomyces cerevisiae etabliert. Diese besteht aus einem Rotlicht-sensitiven Photorezeptor und seinem interagierenden Partner aus Arabidopsis thaliana, welche in lichtabh{\"a}ngiger Weise miteinander agieren. Diese Interaktion wurde genutzt, um zwei Rotlicht-aktivierbare Proteine zu erstellen: Einen Transkriptionsfaktor, der nach Applikation eines Lichtpulses die Produktion eines frei w{\"a}hlbaren Proteins stimuliert, sowie eine Cre Rekombinase, die ebenfalls nach Bestrahlung mit einer bestimmten Wellenl{\"a}nge die zufallsbasierte Reorganisation bestimmter DNS-Konstrukte erm{\"o}glicht. Zusammenfassend wurden damit drei Werkzeuge f{\"u}r die synthetische Biologie etabliert. Diese erm{\"o}glichen den Aufbau von komplexen Biosynthesewegen, deren Licht-abh{\"a}ngige Regulation, sowie die zufallsbasierte Rekombination zu Optimierungszwecken.},
  language  = {en}
}
@article{HochreinMitchellSchulzetal.2018,
  author    = {Hochrein, Lena and Mitchell, Leslie A. and Schulz, Karina and Messerschmidt, Katrin and M{\"u}ller-R{\"o}ber, Bernd},
  title     = {L-SCRaMbLE as a tool for light-controlled Cre-mediated recombination in yeast},
  series = {Nature Communications},
  volume    = {9},
  journal   = {Nature Communications},
  publisher = {Nature Publ. Group},
  address   = {London},
  issn      = {2041-1723},
  doi       = {10.1038/s41467-017-02208-6},
  pages     = {10},
  year      = {2018},
  abstract  = {The synthetic yeast genome constructed by the International Synthetic Yeast Sc2.0 consortium adds thousands of loxPsym recombination sites to all 16 redesigned chromosomes, allowing the shuffling of Sc2.0 chromosome parts by the Cre-loxP recombination system thereby enabling genome evolution experiments. Here, we present L-SCRaMbLE, a lightcontrolled Cre recombinase for use in the yeast Saccharomyces cerevisiae. L-SCRaMbLE allows tight regulation of recombinase activity with up to 179-fold induction upon exposure to red light. The extent of recombination depends on induction time and concentration of the chromophore phycocyanobilin (PCB), which can be easily adjusted. The tool presented here provides improved recombination control over the previously reported estradiol-dependent SCRaMbLE induction system, mediating a larger variety of possible recombination events in SCRaMbLE-ing a reporter plasmid. Thereby, L-SCRaMbLE boosts the potential for further customization and provides a facile application for use in the S. cerevisiae genome reengineering project Sc2.0 or in other recombination-based systems.},
  language  = {en}
}
@misc{MesserschmidtMachensHochreinetal.2018,
  author    = {Messerschmidt, Katrin and Machens, Fabian and Hochrein, Lena and Naseri, Gita},
  title     = {Orthogonal, light-inducible protein expression platform in yeast Sacchararomyces cerevisiae},
  series = {New biotechnology},
  volume    = {44},
  journal   = {New biotechnology},
  publisher = {Elsevier},
  address   = {Amsterdam},
  issn      = {1871-6784},
  doi       = {10.1016/j.nbt.2018.05.153},
  pages     = {S19 -- S19},
  year      = {2018},
  language  = {en}
}