@article{UhlemannBansseLudwigetal.1995, author = {Uhlemann, Erhard and Banße, Wolfgang and Ludwig, Eberhard and Mickler, Wulfhard and Hahn, Ekkehardt and L{\"u}gger, Thomas and Lehmann, Andreas}, title = {Mangan(IV)-Komplexe mit dreiz{\"a}hnigen diaciden Liganden : Kristallstruktur von Acetylacetonato- salicylaldehyd-benzoylhydrazonato(2-methanol-mangan(III)}, year = {1995}, language = {de} } @article{UhlemannBansseLudwigetal.1994, author = {Uhlemann, Erhard and Banße, Wolfgang and Ludwig, Eberhard and Schilde, Uwe and Weller, Frank and Lehmann, Andreas}, title = {Template-Reaktion von Bis(acetylacetonato)-dioxo-molybd{\"a}n(VI) mit Benzoylhydrazin}, year = {1994}, language = {de} } @article{BansseFliegnerHennigetal.1997, author = {Banße, Wolfgang and Fliegner, Jana Ute and Hennig, H. and Lehmann, Andreas and Uhlemann, Erhard and Tschwatschal, F.}, title = {Ligand exchange reactions of molybdenum hexacarbonyl with tridentate diacidic ligands}, year = {1997}, language = {en} } @article{HermannsKunold2022, author = {Hermanns, Jolanda and Kunold, Helen}, title = {Mechanism comics as a task in a written exam in organic chemistry for pre-service chemistry teachers}, series = {Chemistry teacher international : best practices in chemistry education}, volume = {4}, journal = {Chemistry teacher international : best practices in chemistry education}, number = {3}, publisher = {De Gruyter}, address = {Berlin}, issn = {2569-3263}, doi = {10.1515/cti-2021-0035}, pages = {259 -- 269}, year = {2022}, abstract = {In this paper, we describe and evaluate a study on the use of mechanism comics for writing solutions to a task in a written exam for the course "Organic Chemistry I for Pre-Service Chemistry Teachers." The students had to design a reaction mechanism for a reaction that was unknown to them and write captions explaining every step of their reaction mechanism. The students' work was evaluated using the method of qualitative content analysis in four rounds by both authors. The majority of the captions were coded as "descriptive" and only a minority as "causal." This means that the students mostly described "what" happened, but seldom "why" this happened. Implicit electron movement was also described more often than explicit electron movement. The majority of the captions were technically correct. In summary, the students were capable of designing and describing a reaction mechanism for a previously unknown reaction. The quality of their reasoning could be improved, however. In the new course, the quality of students' mechanistic reasoning and then especially their explanations of "why" mechanistic steps occur will be given much clearer emphasis.}, language = {en} } @article{VorburgerNedielkovBrosigetal.2016, author = {Vorburger, Thomas and Nedielkov, Ruslan and Brosig, Alexander and Bok, Eva and Schunke, Emina and Steffen, Wojtek and Mayer, Sonja and Goetz, Friedrich and M{\"o}ller, Heiko Michael and Steuber, Julia}, title = {Role of the Na+-translocating NADH:quinone oxidoreductase in voltage generation and Na+ extrusion in Vibrio cholerae}, series = {Biochimica et biophysica acta : Bioenergetics}, volume = {1857}, journal = {Biochimica et biophysica acta : Bioenergetics}, publisher = {Elsevier}, address = {Amsterdam}, issn = {0005-2728}, doi = {10.1016/j.bbabio.2015.12.010}, pages = {473 -- 482}, year = {2016}, abstract = {For Vibrio cholerae, the coordinated import and export of Na+ is crucial for adaptation to habitats with different osmolarities. We investigated the Na+-extruding branch of the sodium cycle in this human pathogen by in vivo Na-23-NMR spectroscopy. The Na+ extrusion activity of cells was monitored after adding glucose which stimulated respiration via the Na+-translocating NADH:quinone oxidoreductase (Na+-NQR). In a V. cholerae deletion mutant devoid of the Na+-NQR encoding genes (nqrA-F), rates of respiratory Na+ extrusion were decreased by a factor of four, but the cytoplasmic Na+ concentration was essentially unchanged. Furthermore, the mutant was impaired in formation of transmembrane voltage (Delta psi, inside negative) and did not grow under hypoosmotic conditions at pH 8.2 or above. This growth defect could be complemented by transformation with the plasmid encoded nqr operon. In an alkaline environment, Na+/H+ antiporters acidify the cytoplasm at the expense of the transmembrane voltage. It is proposed that, at alkaline pH and limiting Na+ concentrations, the Na+-NQR is crucial for generation of a transmembrane voltage to drive the import of H+ by electrogenic Na+/H+ antiporters. Our study provides the basis to understand the role of the Na+-NQR in pathogenicity of V. cholerae and other pathogens relying on this primary Na+ pump for respiration. (C) 2015 Elsevier B.V. All rights reserved.}, language = {en} } @inproceedings{RamadanGuerreroNedielkovetal.2021, author = {Ramadan, Shahenda and Guerrero, Paula and Nedielkov, Ruslan and Klishin, Nikolai and Dimova, Rumiana and Silva, Daniel V. and M{\"o}ller, Heiko}, title = {Building a mimetic system for unraveling protein-protein interactions on membranes}, series = {European biophysics journal : with biophysics letters ; an international journal of biophysics}, volume = {50}, booktitle = {European biophysics journal : with biophysics letters ; an international journal of biophysics}, number = {SUPPL 1}, publisher = {Springer}, address = {Berlin ; Heidelberg ; New York}, issn = {0175-7571}, doi = {10.1007/s00249-021-01558-w}, pages = {S153 -- S153}, year = {2021}, language = {en} } @article{PruefertBeitzReichetal.2022, author = {Pr{\"u}fert, Christian and Beitz, Toralf and Reich, Olaf and L{\"o}hmannsr{\"o}ben, Hans-Gerd}, title = {Inline process analysis of copper-bearing aerosols using laser-induced breakdown spectroscopy, laser-induced incandescence and optical imaging}, series = {Spectrochimica acta, Part B, Atomic spectroscopy}, volume = {197}, journal = {Spectrochimica acta, Part B, Atomic spectroscopy}, publisher = {Elsevier}, address = {Amsterdam [u.a.]}, issn = {0584-8547}, doi = {10.1016/j.sab.2022.106527}, pages = {11}, year = {2022}, abstract = {The quantification and identification of aerosols in industry plays a key role in process monitoring and control and lays the foundation for process automation aspired by the industry 4.0 initiative. However, measuring particulate matter's mass and number concentrations in harsh environments poses great analytical constraints. The presented approach comprises a comprehensive set of light-and imaging-based techniques, all contactless, in-line, and real-time. It includes, but is not limited to, stroboscopic imaging, laser-induced breakdown spectroscopy (LIBS) and laser-induced incandescence (LII). Stroboscopic imaging confirmed the particles sphericity and was used to measure the particle number density. A phase-selective LIBS setup with low fluence and 500 Hz repetition rate was used to classify each particle with a single-pulse and in real time. Simultaneously, the created plasma was captured by CCD imaging to determine the detection volume and hit rate of the LIBS setup. Both data sets combined were converted to a particle number density, which was consistent with the particle number density of the stroboscopic measurements. Furthermore, using a photodiode and microphone in parallel to the LIBS setup allowed for the photoacoustic normalization of the spectral line intensity at the laser repetition rate of 500 Hz. This was done as a partial photoacoustic normalization method with the cut-off based on the coefficient of variation (CV), reducing it by 25\%. Aside from that photodiode and microphone were proven to be valuable event counting with the advantage of the less spatially constricted. A second laser setup was used for laser -induced incandescence (LII) making it possible to classify the particles based on their incandescence tendency. Given its larger probing volume, LII could be employed at very low particle number densities. With respect to the current literature, this is the first approach of using LII as an in-line, real-time analytical technique for the compositional classification of metal-bearing aerosols.}, language = {en} } @article{WessigBadetkoKoebe2022, author = {Wessig, Pablo and Badetko, Dominik and Koebe, Michael}, title = {Triplet sensitized Photo-Dehydro-Diels-Alder reaction}, series = {ChemistrySelect}, volume = {7}, journal = {ChemistrySelect}, number = {38}, publisher = {Wiley-VCH}, address = {Weinheim}, issn = {2365-6549}, doi = {10.1002/slct.202202648}, pages = {6}, year = {2022}, abstract = {We report on the triplet sensitization of the intramolecular Photo-Dehydro-Diels-Alder (PDDA) reaction of two diaryl suberates bearing methyl propiolate chromophors. Compared with the non-sensitized irradiation, considerably increased yields could be observed. Moreover, it is possible to use the more efficient UVA lamps instead of UVB lamps. Among three investigated sensitizers (xanthone, benzophenone, thioxanthone) xanthone gave the best results.}, language = {en} } @phdthesis{Martin2024, author = {Martin, Johannes}, title = {Synthesis of protein-polymer conjugates and block copolymers via sortase-mediated ligation}, doi = {10.25932/publishup-64566}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:517-opus4-645669}, school = {Universit{\"a}t Potsdam}, pages = {XVII, 150}, year = {2024}, abstract = {In den vergangenen Jahrzehnten haben therapeutische Proteine in der pharmazeutischen Industrie mehr und mehr an Bedeutung gewonnen. Werden Proteine nichtmenschlichen Ursprungs verwendet, kann es jedoch zu einer Immunreaktion kommen, sodass das Protein sehr schnell aus dem K{\"o}rper ausgeschieden oder abgebaut wird. Um die Zirkulationszeit im Blut signifikant zu verl{\"a}ngern, werden die Proteine mit synthetischen Polymeren modifiziert (Protein-Polymer-Konjugate). Die Proteine aller heute auf dem Markt erh{\"a}ltlichen Medikamente dieser Art tragen eine oder mehrere Polymerketten aus Poly(ethylenglycol) (PEG). Ein Nachteil der PEGylierung ist, dass viele Patienten bei regelm{\"a}ßiger Einnahme dieser Medikamente Antik{\"o}rper gegen PEG entwickeln, die den effizienzsteigernden Effekt der PEGylierung wieder aufheben. Ein weiterer Nachteil der PEGylierung ist die oftmals deutlich verringerte Aktivit{\"a}t der Konjugate im Vergleich zum nativen Protein. Der Grund daf{\"u}r ist die Herstellungsmethode der Konjugate, bei der meist die prim{\"a}ren Amine der Lysin-Seitenketten und der N-Terminus des Proteins genutzt werden. Da die meisten Proteine mehrere gut zug{\"a}ngliche Lysine aufweisen, werden oft unterschiedliche und teilweise mehrere Lysine mit PEG funktionalisiert, was zu einer Mischung an Regioisomeren f{\"u}hrt. Je nach Position der PEG-Kette kann das aktive Zentrum abgeschirmt oder die 3D-Struktur des Proteins ver{\"a}ndert werden, was zu einem teilweise drastischen Aktivit{\"a}tsabfall f{\"u}hrt. In dieser Arbeit wurde eine neuartige Methode zur Ligation von Makromolek{\"u}len untersucht. Die Verwendung eines Enzyms als Katalysator zur Verbindung zweier Makromolek{\"u}le ist bisher wenig untersucht und ineffizient. Als Enzym wurde Sortase A ausgew{\"a}hlt, eine gut untersuchte Ligase aus der Familie der Transpeptidasen, welche die Ligation zweier Peptide katalysieren kann. Ein Nachteil dieser Sortase-vermittelten Ligation ist, dass es sich um eine Gleichgewichtsreaktion handelt, wodurch hohe Ausbeuten schwierig zu erreichen sind. Im Rahmen dieser Dissertation wurden zwei zuvor entwickelte Methoden zur Verschiebung des Gleichgewichts ohne Einsatz eines großen {\"U}berschusses von einem Edukt f{\"u}r Makromolek{\"u}le {\"u}berpr{\"u}ft. Zur Durchf{\"u}hrung der Sortase-vermittelten Ligation werden zwei komplement{\"a}re Peptidsequenzen verwendet, die Erkennungssequenz und das Nukleophil. Um eine systematische Untersuchung durchf{\"u}hren zu k{\"o}nnen, wurden alle n{\"o}tigen Bausteine (Protein-Erkennungssequenz zur Reaktion mit Nukleophil-Polymer und Polymer-Erkennungssequenz mit Nukleophil-Protein) hergestellt. Als Polymerisationstechnik wurde die radikalische Polymerisation mit reversibler Deaktivierung (im Detail, Atom Transfer Radical Polymerization, ATRP und Reversible Addition-Fragmentation Chain Transfer, RAFT polymerization) gew{\"a}hlt, um eine enge Molmassenverteilung zu erreichen. Die Herstellung der Bausteine begann mit der Synthese der Peptide via automatisierter Festphasen-Peptidsynthese, um eine einfache {\"A}nderung der Peptidsequenz zu gew{\"a}hrleisten und um eine Modifizierung der Polymerkette nach der Polymerisation zu umgehen. Um die ben{\"o}tigte unterschiedliche Funktionalit{\"a}t der zwei Peptidsequenzen (freier C-Terminus bei der Erkennungssequenz bzw. freier N-Terminus bei dem Nukleophil) zu erreichen, wurden verschiedene Linker zwischen Harz und Peptid verwendet. Danach wurde der Ketten{\"u}bertr{\"a}ger (chain transfer agent, CTA) zur Kontrolle der Polymerisation mit dem auf dem Harz befindlichen Peptid gekoppelt. Die f{\"u}r die anschließende Polymerisation verwendeten Monomere basierten auf Acrylamiden und Acrylaten und wurden anhand ihrer Eignung als Alternativen zu PEG ausgew{\"a}hlt. Es wurde eine k{\"u}rzlich entwickelte Technik basierend auf der RAFT-Polymerisation (xanthate-supported photo-iniferter RAFT, XPI-RAFT) verwendet um eine Reihe an Peptid-Polymeren mit unterschiedlichen Molekulargewichten und engen Molekulargewichtsverteilungen herzustellen. Nach Entfernung der Schutzgruppen der Peptid-Seitenketten wurden die Peptid-Polymere zun{\"a}chst genutzt, um mittels Sortase-vermittelter Ligation zwei Polymerketten zu einem Blockcopolymer zu verbinden. Unter Verwendung von Ni2+-Ionen in Kombination mit einer Verl{\"a}ngerung der Erkennungssequenz um ein Histidin zur Unterdr{\"u}ckung der R{\"u}ckreaktion konnte ein maximaler Umsatz von 70 \% erreicht werden. Dabei zeigte sich ein oberes Limit von durchschnittlich 100 Wiederholungseinheiten; die Ligation von l{\"a}ngeren Polymeren war nicht erfolgreich. Danach wurden ein Modellprotein und ein Nanobody mit vielversprechenden medizinischen Eigenschaften mit den f{\"u}r die enzymkatalysierte Ligation ben{\"o}tigten Peptidsequenzen f{\"u}r die Kopplung mit den zuvor hergestellten Peptid-Polymeren verwendet. Dabei konnte bei Verwendung des Modellproteins keine Bildung von Protein-Polymer-Konjugaten beobachtet werden. Der Nanobody konnte dagegen C-terminal mit einem Polymer funktionalisiert werden. Dabei wurde eine {\"a}hnliche Limitierung in der Polymer-Kettenl{\"a}nge beobachtet wie zuvor. Die auf Ni-Ionen basierte Strategie zur Gleichgewichtsverschiebung hatte hier keinen ausschlaggebenden Effekt, w{\"a}hrend die Verwendung von einem {\"U}berschuss an Polymer zur vollst{\"a}ndigen Umsetzung des Edukt-Nanobody f{\"u}hrte. Die erhaltenen Daten aus diesem Projekt bilden eine gute Basis f{\"u}r weitere Forschung in dem vielversprechenden Feld der enzymkatalysierten Herstellung von Protein-Polymer-Konjugaten und Blockcopolymeren. Langfristig k{\"o}nnte diese Herangehensweise eine vielseitig einsetzbare Herstellungsmethode von ortsspezifischen therapeutischen Protein-Polymer Konjugaten darstellen, welche sowohl eine hohe Aktivit{\"a}t als auch eine lange Zirkulationszeit im Blut aufweisen.}, language = {en} } @article{Titov2022, author = {Titov, Evgenii}, title = {Effect of conformational disorder on exciton states of an azobenzene aggregate}, series = {Physical chemistry, chemical physics : a journal of European Chemical Societies}, volume = {24}, journal = {Physical chemistry, chemical physics : a journal of European Chemical Societies}, number = {39}, publisher = {Royal Society of Chemistry}, address = {Cambridge}, issn = {1463-9076}, doi = {10.1039/d2cp02774g}, pages = {24002 -- 24006}, year = {2022}, abstract = {Azobenzene is a prototypical molecular photoswitch, widely used to trigger a variety of transformations at different length scales. In systems like self-assembled monolayers or micelles, azobenzene chromophores may interact with each other, which gives rise to the emergence of exciton states. Here, using first-principles calculations, we investigate how conformational disorder (induced, e.g., by thermal fluctuations) affects localization of these states, on an example of an H-type azobenzene tetramer. We find that conformational disorder leads to (partial) exciton localization on a single-geometry level, whereas ensemble-averaging results in a delocalized picture. The pi pi* and n pi* excitons at high and low temperatures are discussed.}, language = {en} }