@misc{BiterovaEsmaeeliMoghaddamTabalvandaniAlanenetal.2018, author = {Biterova, Ekaterina and Esmaeeli Moghaddam Tabalvandani, Mariam and Alanen, Heli I. and Saaranen, Mirva and Ruddock, Lloyd W.}, title = {Structures of Angptl3 and Angptl4}, series = {Postprints der Universit{\"a}t Potsdam : Mathematisch-Naturwissenschaftliche Reihe}, journal = {Postprints der Universit{\"a}t Potsdam : Mathematisch-Naturwissenschaftliche Reihe}, number = {1048}, issn = {1866-8372}, doi = {10.25932/publishup-46794}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:517-opus4-467943}, pages = {14}, year = {2018}, abstract = {Coronary artery disease is the most common cause of death globally and is linked to a number of risk factors including serum low density lipoprotein, high density lipoprotein, triglycerides and lipoprotein(a). Recently two proteins, angiopoietin-like protein 3 and 4, have emerged from genetic studies as being factors that significantly modulate plasma triglyceride levels and coronary artery disease. The exact function and mechanism of action of both proteins remains to be elucidated, however, mutations in these proteins results in up to 34\% reduction in coronary artery disease and inhibition of function results in reduced plasma triglyceride levels. Here we report the crystal structures of the fibrinogen-like domains of both proteins. These structures offer new insights into the reported loss of function mutations, the mechanisms of action of the proteins and open up the possibility for the rational design of low molecular weight inhibitors for intervention in coronary artery disease.}, language = {en} } @misc{FritzDeshpandeBouchardetal.2015, author = {Fritz, Michael and Deshpande, B. N. and Bouchard, F. and H{\"o}gstr{\"o}m, E. and Malenfant-Lepage, J. and Morgenstern, Anne and Nieuwendam, A. and Oliva, M. and Paquette, M. and Rudy, A. C. A. and Siewert, M. B. and Sj{\"o}berg, Y. and Weege, Stefanie}, title = {Brief communication}, series = {Postprints der Universit{\"a}t Potsdam : Mathematisch Naturwissenschaftliche Reihe}, journal = {Postprints der Universit{\"a}t Potsdam : Mathematisch Naturwissenschaftliche Reihe}, number = {490}, issn = {1866-8372}, doi = {10.25932/publishup-40809}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:517-opus4-408096}, pages = {6}, year = {2015}, abstract = {Accelerating climate change and increased economic and environmental interests in permafrost-affected regions have resulted in an acute need for more directed permafrost research. In June 2014, 88 early career researchers convened to identify future priorities for permafrost research. This multidisciplinary forum concluded that five research topics deserve greatest attention: permafrost landscape dynamics, permafrost thermal modeling, integration of traditional knowledge, spatial distribution of ground ice, and engineering issues. These topics underline the need for integrated research across a spectrum of permafrost-related domains and constitute a contribution to the Third International Conference on Arctic Research Planning (ICARP III).}, language = {en} } @misc{GellertHaeuslerSuhretal.2018, author = {Gellert, Paul and H{\"a}usler, Andreas and Suhr, Ralf and Gholami, Maryam and Rapp, Michael Armin and Kuhlmey, Adelheid and Nordheim, Johanna}, title = {Testing the stress-buffering hypothesis of social support in couples coping with early-stage dementia}, series = {Postprints der Universit{\"a}t Potsdam : Humanwissenschaftliche Reihe}, journal = {Postprints der Universit{\"a}t Potsdam : Humanwissenschaftliche Reihe}, number = {657}, issn = {1866-8364}, doi = {10.25932/publishup-44627}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:517-opus4-446270}, pages = {16}, year = {2018}, abstract = {Purpose To test whether the negative relationship between perceived stress and quality of life (Hypothesis 1) can be buffered by perceived social support in patients with dementia as well as in caregivers individually (Hypothesis 2: actor effects) and across partners (Hypothesis 3: partner effects and actor-partner effects). Method A total of 108 couples (N = 216 individuals) comprised of one individual with early-stage dementia and one caregiving partner were assessed at baseline and one month apart. Moderation effects were investigated by applying linear mixed models and actor-partner interdependence models. Results Although the stress-quality of life association was more pronounced in caregivers (beta = -.63, p<.001) compared to patients (beta= -.31, p<.001), this association was equally moderated by social support in patients (beta = .14, p<.05) and in the caregivers (beta =.13, p<.05). From one partner to his or her counterpart, the partner buffering and actor-partner-buffering effect were not present. Conclusion The stress-buffering effect has been replicated in individuals with dementia and caregivers but not across partners. Interventions to improve quality of life through perceived social support should not only focus on caregivers, but should incorporate both partners.}, language = {en} } @phdthesis{Kuester2002, author = {K{\"u}ster, Frank}, title = {Das Lektin aus der Erbse Pisum sativum : Bindungsstudien, Monomer-Dimer-Gleichgewicht und R{\"u}ckfaltung aus Fragmenten}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:517-0000612}, school = {Universit{\"a}t Potsdam}, year = {2002}, abstract = {Das Lektin aus Pisum sativum, der Gartenerbse, ist Teil der Familie der Leguminosenlektine. Diese Proteine haben untereinander eine hohe Sequenzhomologie, und die Struktur ihrer Monomere, ein all-ß-Motiv, ist hoch konserviert. Dagegen gibt es innerhalb der Familie eine große Vielfalt an unterschiedlichen Quart{\"a}rstrukturen, die Gegenstand kristallographischer und theoretischer Arbeiten waren. Das Erbsenlektin ist ein dimeres Leguminosenlektin mit einer Besonderheit in seiner Struktur: Nach der Faltung in der Zelle wird aus einem Loop eine kurze Aminos{\"a}uresequenz herausgeschnitten, so dass sich in jeder Untereinheit zwei unabh{\"a}ngige Polypeptidketten befinden. Beide Ketten sind aber stark miteinander verschr{\"a}nkt und bilden eine gemeinsame strukturelle Dom{\"a}ne. Wie alle Lektine bindet Erbsenlektin komplexe Oligosaccharide, doch sind seine physiologische Rolle und der nat{\"u}rliche Ligand unbekannt. In dieser Arbeit wurden Versuche zur Entwicklung eines Funktionstests f{\"u}r Erbsenlektin durchgef{\"u}hrt und seine Faltung, Stabilit{\"a}t und Monomer-Dimer-Gleichgewicht charakterisiert. Um die spezifische Rolle der Prozessierung f{\"u}r Stabilit{\"a}t und Faltung zu untersuchen, wurde ein unprozessiertes Konstrukt in E. coli exprimiert und mit der prozessierten Form verglichen. Beide Proteine zeigen die gleiche kinetische Stabilit{\"a}t gegen{\"u}ber chemischer Denaturierung. Sie denaturieren extrem langsam, weil nur die isolierten Untereinheiten entfalten k{\"o}nnen und das Monomer-Dimer-Gleichgewicht bei mittleren Konzentrationen an Denaturierungsmittel auf der Seite der Dimere liegt. Durch die extrem langsame Entfaltung zeigen beide Proteine eine apparente Hysterese im Gleichgewichts{\"u}bergang, und es ist nicht m{\"o}glich, die thermodynamische Stabilit{\"a}t zu bestimmen. Die Stabilit{\"a}t und die Geschwindigkeit der Assoziation und Dissoziation in die prozessierten bzw. nichtprozessierten Untereinheiten sind f{\"u}r beide Proteine gleich. Dar{\"u}ber hinaus konnte gezeigt werden, dass auch unter nicht-denaturierenden Bedingungen die Untereinheiten zwischen den Dimeren ausgetauscht werden. Die Renaturierung der unprozessierten Variante ist unter stark nativen Bedingungen zu 100 \% m{\"o}glich. Das prozessierte Protein dagegen renaturiert nur zu etwa 50 \%, und durch die Prozessierung ist die Faltung stark verlangsamt, der Faltungsprozess ist erst nach mehreren Tagen abgeschlossen. Im Laufe der Renaturierung wird ein Intermediat populiert, in dem die l{\"a}ngere der beiden Polypeptidketten ein Homodimer mit nativ{\"a}hnlicher Untereinheitenkontaktfl{\"a}che bildet. Der geschwindigkeitsbestimmende Schritt der Renaturierung ist die Assoziation der entfalteten k{\"u}rzeren Kette mit diesem Dimer.}, language = {de} }